Traceback (most recent call last): File "E:/403/myworld/VGAE/trainTest.py", line 103, in <module> train(model, optimizer, train_loader, device) File "E:/403/myworld/VGAE/trainTest.py", line 52, in train for batch, data in enumerate(train_loader): File "D:\code\myworld\lib\site-packages\torch\utils\data\dataloader.py", line 633, in __next__ data = self._next_data() File "D:\code\myworld\lib\site-packages\torch\utils\data\dataloader.py", line 676, in _next_data index = self._next_index() # may raise StopIteration File "D:\code\myworld\lib\site-packages\torch\utils\data\dataloader.py", line 623, in _next_index return next(self._sampler_iter) # may raise StopIteration File "D:\code\myworld\lib\site-packages\torch\utils\data\sampler.py", line 254, in __iter__ for idx in self.sampler: TypeError: 'MultiLayerFullNeighborSampler' object is not iterable
时间: 2023-09-03 11:11:40 浏览: 186
这个错误通常出现在 PyTorch 中使用自定义的采样器时,采样器没有实现 __iter__ 方法或者 __iter__ 方法返回了不可迭代的对象。根据错误信息,这里使用的采样器是 MultiLayerFullNeighborSampler,该采样器没有实现 __iter__ 方法。
解决方法是在 MultiLayerFullNeighborSampler 类中实现 __iter__ 方法,使其返回一个可迭代的对象,或者使用其他已经实现了 __iter__ 方法的采样器。具体实现方法可以参考 PyTorch 中自带的采样器的实现方式。
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Traceback (most recent call last): File "E:/403/myworld/VGAE/trainTest.py", line 127, in <module> train(model, optimizer, dataBase, device) File "E:/403/myworld/VGAE/trainTest.py", line 55, in train for index,adj,features,labels in train_loader: File "E:/403/myworld/VGAE/trainTest.py", line 105, in __next__ graph,label = self.graphs[self.current],self.labels["labels"][self.current] TypeError: tuple indices must be integers or slices, not str
这个错误提示表示你尝试使用一个字符串作为元组的索引,而元组的索引只能是整数或切片。具体来说,可能是在你的代码中使用了一个字符串作为索引,而实际上需要使用整数或切片。
根据你提供的代码,可能是在train_loader中的__next__方法中,尝试使用了一个字符串作为索引,如下所示:
```python
graph,label = self.graphs[self.current], self.labels["labels"][self.current]
```
这里的self.labels["labels"]是一个字符串,需要将其替换为整数或切片,具体根据你的数据格式来决定。如果你的标签是一个整数或列表,可以尝试将其替换为以下代码:
```python
graph, label = self.graphs[self.current], self.labels[self.current]
```
如果你的标签是一个字典,需要根据字典的结构来进行索引。例如,如果你的标签字典的结构如下:
```python
labels = {"node_labels": [1, 2, 3, 4, 5], "edge_labels": [1, 2, 3, 4]}
```
则可以使用以下代码进行索引:
```python
graph, node_label = self.graphs[self.current], self.labels["node_labels"][self.current]
```
希望这能帮助你解决问题。
Traceback (most recent call last): File "E:/403/myworld/VGAE/trainTest.py", line 116, in <module> train(model, optimizer, dataBase, device) File "E:/403/myworld/VGAE/trainTest.py", line 57, in train loss = loss_function(output, labels, mu, logvar, adj) File "E:/403/myworld/VGAE/trainTest.py", line 41, in loss_function recon_loss = criterion(output.view(-1), torch.from_numpy(adj).view(-1))# 重构误差 TypeError: expected np.ndarray (got csr_array)
根据错误提示,`criterion`期望接收一个NumPy数组作为输入,但是您传递给它的是一个`csr_matrix`类型的稀疏矩阵对象`adj`。因此,您需要将`csr_matrix`类型的稀疏矩阵对象转换为NumPy数组。
可以使用`toarray()`方法将稀疏矩阵转换为稠密矩阵,然后使用`.view(-1)`方法将二维矩阵转换为一维向量:
```python
import torch
import dgl
import numpy as np
from scipy.sparse import csr_matrix
with open('graph.bin', 'rb') as f:
graph_data = np.load(f, allow_pickle=True)
graph = dgl.graph((graph_data['edge_index'][0], graph_data['edge_index'][1]))
adj = csr_matrix((graph_data['adjacency_matrix'] != 0).astype(np.float32)) # 转换为csr_matrix类型
model = MyModel()
output = model(graph)
criterion = torch.nn.BCEWithLogitsLoss()
recon_loss = criterion(output.view(-1), torch.from_numpy(adj.toarray()).view(-1)) # 转换为NumPy数组
```
在上述示例代码中,我们使用`csr_matrix`类型将邻接矩阵转换为稀疏矩阵。然后,我们使用`toarray()`方法将稀疏矩阵转换为稠密矩阵,最后使用`.view(-1)`方法将二维矩阵转换为一维向量。最终,我们将转换后的NumPy数组传递给损失函数`criterion`进行计算。
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