data_mt.gene <- read.table("4.All_SMT/6.Single_function_gene/3.mt.gene/HSM.mRNA.cpm.Symbol.mt.gene.txt", + header=TRUE, row.names=1,col.names=1:84) Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec, : line 14523 did not have 85 elements In addition: Warning message: In read.table("mt.gene.txt", : 表头名称和'col.names'的长度不一样

这个错误信息表明指定的列名长度与实际的列数不匹配。在你的代码中，你使用了`col.names=1:84`将列名设置为1到84，但是读取的文件中实际的列数可能不是84。这可能导致R无法正确读取数据并发出错误警告。

为了解决这个问题，你需要确保指定的列名长度与实际的列数相同。你可以通过查看文件中的列数来确定实际的列数。例如，你可以使用以下代码来查看文件中的列数：

ncol(read.table("4.All_SMT/6.Single_function_gene/3.mt.gene/HSM.mRNA.cpm.Symbol.mt.gene.txt", header=TRUE, nrow=1))

这将输出文件中的列数。一旦你知道了实际的列数，你就可以将`col.names`参数设置为相应的值。

相关问题

df_boxplot_exp_mt.gene <- as.data.frame(p_boxplot_exp_mt.gene)

这行代码是将 `p_boxplot_exp_mt.gene` 对象转换为数据框对象 `df_boxplot_exp_mt.gene`。这是因为 `ggplot2` 绘图函数需要数据框作为输入，而 `boxplot` 函数的输出结果是一个列表，不方便直接用于绘图。

转换为数据框后，您就可以使用 `ggplot` 函数对数据进行可视化。常见的数据可视化函数包括 `ggplot`、`plot`、`hist`、`boxplot` 等，它们都是 R 语言中常用的数据可视化函数。其中，`ggplot2` 包提供了强大的绘图功能，可以绘制高质量的图形，因此被广泛使用。

data_mt.gene <- read.table("mt.gene.txt", + header=TRUE, row.names=1) Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec, : line 1 did not have 86 elements，第一行如何设置为84？

如果你想将第一行设置为84列而不是默认的86列，可以使用`col.names`参数来指定列名。具体来说，你可以使用以下代码：

data_mt.gene <- read.table("mt.gene.txt", header=TRUE, row.names=1, col.names=1:84)

在这个例子中，`col.names`参数将第一列到第84列的列名设置为1到84。这将告诉R只读取前84列，而忽略第85列和第86列。这样做可能会导致一些数据丢失，所以确保你的数据文件中只有84列数据。