无法打开URL'https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/000/001/405/GCA_000001405.15_GRCh38_no_alt_analysis_set.fna.gz' 此外: Warning message: In download.file(url, destfile, mode = "wb") : cannot open URL 'https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/000/001/405/GCA_000001405.15_GRCh38_no_alt_analysis_set.fna.gz': HTTP status was '404 Not Found' >
时间: 2023-08-11 08:08:46 浏览: 53
这个错误信息表明下载链接无法访问或文件不存在。您可以尝试使用其他参考基因组文件的下载链接,或者检查您的网络连接是否正常。以下是一个有效的下载链接:
```R
library(RCurl)
url <- "https://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg38/bigZips/hg38.fa.gz"
destfile <- "hg38.fa.gz"
download.file(url, destfile, mode="wb")
```
这将从UCSC Genome Browser的FTP站点下载hg38版本的参考基因组文件,并将其保存在当前工作目录中的名为"hg38.fa.gz"的文件中。您需要安装并加载RCurl包才能使用`download.file()`函数。
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ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/LATEST/
引用\[1\]:现在是ncbi-blast-2.12.0+版本,下载网址:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/。引用\[3\]:对于windows 2000/xp 用户,下载blast-2.2.18-ia32-win32.exe安装文件 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/LATEST/blast-2.2.18-ia32-win32.exe。
问题: ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/LATEST/是什么?
回答: 抱歉,我没有找到提供的引用内容中关于ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/LATEST/的信息。请注意,正确的网址是ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/LATEST/。
#### 引用[.reference_title]
- *1* *2* [Alignment--本地blast使用详解1-数据库序列检索下载及比对](https://blog.csdn.net/qq_39859424/article/details/121575998)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^control_2,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
- *3* [Blast本地化:window平台下blast软件的安装](https://blog.csdn.net/likelet/article/details/7245364)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^control_2,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
[ .reference_list ]
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/000/001/405/GCF_000001405.39_GRCh38.p13/GCF_000001405.39_GRCh38.p13_genomic.gff.gz
根据提供的引用内容,您提到了一个FTP链接:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/000/001/405/GCF_000001405.39_GRCh38.p13/GCF_000001405.39_GRCh38.p13_genomic.gff.gz。这是一个基因组注释文件(GFF文件)的链接。GFF文件是一种常用的基因组注释文件格式,用于描述基因组的结构和功能信息。
要使用该链接下载GFF文件,您可以使用FTP客户端或命令行工具,如wget或curl。以下是使用wget命令下载GFF文件的示例:
```shell
wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/000/001/405/GCF_000001405.39_GRCh38.p13/GCF_000001405.39_GRCh38.p13_genomic.gff.gz
```
请注意,您需要确保您的计算机上已安装wget或curl,并且具有访问该FTP链接的权限。