人工免疫算法python
时间: 2023-07-25 22:41:47 浏览: 111
一种专注于处理微生物组数据 的人工免疫系统算法_python_Jupyter _代码_下载
在Python中,可以使用多种库和模块来实现人工免疫算法,例如numpy、scipy、sklearn等等。以下是一个基于numpy库实现的基本的免疫克隆算法的示例代码:
```python
import numpy as np
# 定义目标函数
def objective_function(x):
return np.sum(x**2)
# 初始化免疫克隆算法的参数
pop_size = 20 # 种群大小
clone_rate = 0.5 # 克隆率
mutate_rate = 0.1 # 变异率
max_iter = 100 # 最大迭代次数
gene_length = 10 # 基因长度
# 初始化种群
pop = np.random.rand(pop_size, gene_length)
# 开始迭代
for i in range(max_iter):
# 计算适应度
fitness = np.zeros(pop_size)
for j in range(pop_size):
fitness[j] = objective_function(pop[j])
# 克隆
clone_size = int(clone_rate * pop_size)
clone_fitness = np.sort(fitness)[-clone_size:]
clones = np.zeros((clone_size, gene_length))
for j in range(clone_size):
clones[j] = pop[np.argmax(fitness)]
# 变异
for j in range(clone_size):
for k in range(gene_length):
if np.random.rand() < mutate_rate:
clones[j][k] = np.random.rand()
# 更新种群
pop = np.vstack((pop, clones))
fitness = np.zeros(pop_size)
for j in range(pop_size):
fitness[j] = objective_function(pop[j])
indices = np.argsort(fitness)[-pop_size:]
pop = pop[indices]
# 输出结果
print("最优解:", pop[0])
print("最优值:", objective_function(pop[0]))
```
需要注意的是,这只是一个简单的示例代码,实际应用中需要根据具体问题进行参数的调整和算法的改进。
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