用pubchem里面生成canonical smiles一样的方法用python将smiles转化成canonical smiles,

很好的问题！你可以使用RDKit包中的函数来将SMILES字符串转换为Canonical SMILES。以下是一个示例代码：

from rdkit import Chem

def canonicalize_smiles(smiles):
    mol = Chem.MolFromSmiles(smiles)
    return Chem.MolToSmiles(mol, isomericSmiles=True, canonical=True)

# 使用示例
smiles = 'CC(C)CC1=CC(C)=C(C=C1)C(C)C(=O)O'
canonical_smiles = canonicalize_smiles(smiles)
print(canonical_smiles)

这将输出Canonical SMILES字符串：'CC(C)Cc1cc(C)c(C)c(C(=O)O)cc1C(C)C'。

希望这可以回答你的问题！