R语言利用update将复合对称矩阵拟合到非线性混合效应模型中
时间: 2023-12-09 15:06:19 浏览: 141
可以使用R语言中的`nlme`包来拟合非线性混合效应模型,并利用`update`函数来将复合对称矩阵添加到模型中。
首先,需要安装和加载`nlme`包:
```R
install.packages("nlme")
library(nlme)
```
然后,使用`gnls`函数拟合非线性混合效应模型。例如,假设我们有一个数据集`data`,其中`y`是响应变量,`x1`和`x2`是两个解释变量,`id`是组别变量,`t`是时间变量。我们想要拟合一个非线性混合效应模型,其中随机效应是针对组别的截距和斜率,而固定效应是非线性的:
```R
model <- gnls(y ~ b0 + b1*x1 + b2*x2 + (b0 + b1*t + b2*t^2 | id),
data = data, start = c(b0 = 1, b1 = 0, b2 = 0))
```
上述代码中,`(b0 + b1*t + b2*t^2 | id)`表示随机效应,其中`b0`表示截距,`b1`和`b2`表示斜率,`t`是时间变量。`start`参数表示初始值。
接下来,我们可以使用`update`函数来将复合对称矩阵添加到模型中。例如,假设我们想要添加一个复合对称矩阵`G`,其中对角线元素为1,非对角线元素为0.5:
```R
G <- matrix(0.5, ncol = length(unique(data$id)), nrow = length(unique(data$id)))
diag(G) <- 1
model <- update(model, corr = G)
```
上述代码中,`corr`参数表示相关矩阵,我们将其设置为复合对称矩阵`G`。
最后,我们可以使用`summary`函数来查看模型的拟合结果:
```R
summary(model)
```
总之,我们可以使用R语言中的`nlme`包来拟合非线性混合效应模型,并利用`update`函数将复合对称矩阵添加到模型中。
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