model2 <- coxph(Surv(days, cens) ~ strata(cd40) + factor(arms) + age + wtkg + homo + race + gender, data = data)这个是model2,请解决下面这个问题,用R语言 Run a stratified Cox model with interactions, where all risk factors that violate the PH assumption are stratified (named Model 3). Conduct a likelihood ratio test to choose between Model 2 and Model 3.
时间: 2024-03-04 10:48:10 浏览: 68
生存分析队列研究经典数据:lung+pbc.rar
要运行一个带交互作用的分层Cox模型,可以使用下面的R代码:
```
model3 <- coxph(Surv(days, cens) ~ strata(cd40) + factor(arms) + age + wtkg + homo + race + gender + age:strata(cd40) + wtkg:strata(cd40), data = data)
```
在这个模型中,我们添加了“age:strata(cd40)”和“wtkg:strata(cd40)”这两个交互作用项,表示这些因素在不同的分层组中有不同的影响。同时,我们仍然使用“strata(cd40)”来分层那些违反PH假设的协变量。
为了比较模型2和模型3的拟合效果,我们可以使用对数似然比检验。具体来说,我们可以使用“anova”函数,将这两个模型作为输入参数,并将返回一个p值,用于衡量两个模型之间的显著性差异。
下面是实现这个对数似然比检验的R代码:
```
anova(model2, model3, test = "Chisq")
```
如果p值小于显著性水平(例如0.05),则意味着模型3比模型2更好,我们应该选择模型3。反之,如果p值大于显著性水平,则意味着模型2更好。
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