密度加权Nyström谱聚类代码

以下是使用Python实现密度加权Nyström谱聚类的示例代码：

import numpy as np
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.neighbors import kneighbors_graph
from scipy.sparse.linalg import eigsh

def density_nystrom_spectral_clustering(X, n_clusters, n_components, n_neighbors=10):
    # 计算样本间的距离
    D = kneighbors_graph(X, n_neighbors=n_neighbors, mode='distance')
    D = D.toarray()
    # 计算样本的密度
    gamma = 1.0 / np.median(D)
    rho = np.sum(np.exp(-gamma*D), axis=1)
    # 计算密度加权相似度矩阵
    A = np.exp(-gamma*D)
    for i in range(len(X)):
        A[i, :] = A[i, :] / (rho[i] + 1e-10)
    A = (A + A.T)/2  # 保证对称性
    # 计算Nystrom采样矩阵
    m = len(X)
    idx = np.random.choice(m, n_components, replace=False)
    Z = X[idx]
    C = A[:, idx]
    W = np.linalg.pinv(C) @ A @ np.linalg.pinv(C.T)
    # 计算W的前n_clusters个特征向量
    eigval, eigvec = eigsh(W, n_clusters, which='LA')
    # 对特征向量进行归一化
    Y = eigvec / np.sqrt(np.sum(eigvec**2, axis=1, keepdims=True))
    # 使用k-means算法进行聚类
    kmeans = KMeans(n_clusters=n_clusters)
    kmeans.fit(Y)
    labels = kmeans.labels_
    return labels

# 生成圆环数据集
X, y = make_circles(n_samples=1000, noise=0.05, factor=0.5)

# 进行密度加权Nyström谱聚类
n_clusters = 2
n_components = 200
n_neighbors = 10
labels = density_nystrom_spectral_clustering(X, n_clusters, n_components, n_neighbors)

# 可视化聚类结果
import matplotlib.pyplot as plt
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=labels, cmap='rainbow')
plt.axis('equal')
plt.show()

该代码使用了`sklearn`和`scipy`库提供的函数，可以在运行前先安装这两个库。

首先，使用`make_circles`函数生成圆环数据集，然后调用`density_nystrom_spectral_clustering`函数进行密度加权Nyström谱聚类，最后使用`matplotlib`库可视化聚类结果。

需要注意的是，密度加权Nyström谱聚类需要计算样本间的距离和密度，计算量较大，对于大规模数据集可能会较慢。如果需要加速，可以尝试使用更高效的计算方式，例如使用KD树加速距离计算。