R语言利用lasson回归在差异基因中筛选关键基因代码
时间: 2023-11-16 14:04:48 浏览: 406
下面是利用R语言进行Lasso回归筛选差异基因的代码:
```R
# 假设有一组基因表达数据,其中前n个基因为差异基因
set.seed(123)
n <- 50
p <- 100
x <- matrix(rnorm(n*p), ncol=p)
y <- x[,1:n] %*% rnorm(n) + rnorm(n)
# 进行Lasso回归
library(glmnet)
fit <- glmnet(x, y, alpha=1) # alpha=1表示Lasso回归
plot(fit, xvar="lambda", label=TRUE) # 绘制lambda与系数的关系图
```
在上述代码中,我们首先生成了一组包含50个差异基因的基因表达数据。然后,利用glmnet包中的glmnet函数进行Lasso回归,其中alpha=1表示使用Lasso回归。最后,我们可以绘制lambda与系数的关系图,以帮助我们选择最优的lambda值。
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