def dice_coeff(pred, target): smooth = 1. num = pred.size(0) m1 = pred.view(num, -1) # Flatten m2 = target.view(num, -1) # Flatten intersection = (m1 * m2).sum() return (2. * intersection + smooth) / (m1.sum() + m2.sum() + smooth)

时间: 2024-04-13 09:25:57 浏览: 8
这是一个用于计算 Dice Coefficient 的函数。Dice Coefficient 是一种常用于衡量目标分割模型性能的指标,它衡量预测结果与真实标签的相似程度。 函数接受两个参数 `pred` 和 `target`,分别代表模型的预测结果和真实标签。在函数内部,首先定义了一个平滑因子 `smooth`,用于避免除零错误。 接下来,函数计算了 `pred` 和 `target` 的形状,并将其展平为二维矩阵。然后,计算了两者的交集,并将结果相加。 最后,函数将交集乘以 2 并加上平滑因子,再除以 `pred` 和 `target` 的总和与平滑因子之和。这样就得到了 Dice Coefficient 的值,作为函数的返回值。 请注意,这段代码是用 Python 编写的,其中使用了 PyTorch 的张量操作。如果你有任何关于该函数的问题,请继续提问。
相关问题

def dice_coef_fun(smooth=1): def dice_coef(y_true, y_pred): #求得每个sample的每个类的dice intersection = K.sum(y_true * y_pred, axis=(1,2,3)) union = K.sum(y_true, axis=(1,2,3)) + K.sum(y_pred, axis=(1,2,3)) sample_dices=(2. * intersection + smooth) / (union + smooth) #一维数组 为各个类别的dice #求得每个类的dice dices=K.mean(sample_dices,axis=0) return K.mean(dices) #所有类别dice求平均的dice return dice_coef def dice_coef_loss_fun(smooth=0): def dice_coef_loss(y_true,y_pred): return 1-1-dice_coef_fun(smooth=smooth)(y_true=y_true,y_pred=y_pred) return dice_coef_loss

这段代码定义了两个函数,`dice_coef_fun` 和 `dice_coef_loss_fun`,用于计算 Dice Coefficient 和 Dice Coefficient Loss。 首先是 `dice_coef_fun` 函数,它接受一个平滑因子 `smooth` 的默认值为 1。在函数内部,首先计算了预测值 `y_pred` 和真实标签 `y_true` 的交集,并对其进行求和操作,轴为 (1,2,3)。然后,计算了真实标签和预测值的总和,并同样进行求和操作。最后,根据 Dice Coefficient 的公式,将交集乘以 2 并加上平滑因子,再除以总和与平滑因子之和,得到每个类别的 Dice Coefficient。最终,将所有类别的 Dice Coefficient 求平均,作为函数的返回值。 接下来是 `dice_coef_loss_fun` 函数,它接受一个平滑因子 `smooth` 的默认值为 0。在函数内部,调用了 `dice_coef_fun` 函数,并将 `y_true` 和 `y_pred` 作为参数传入。然后,将 `dice_coef_fun` 的返回值与 1 相减,并再次减去 1,得到 Dice Coefficient Loss 的值,作为函数的返回值。 这段代码使用了 Keras(或者 TensorFlow)的张量操作。如果你有关于这些函数的任何问题,请继续提问。

if cfg.deepsupervision: masks_preds = net(imgs) loss = 0 for masks_pred in masks_preds: tot_cross_entropy = 0 for true_mask, pred in zip(true_masks, masks_pred): pred = (pred > cfg.out_threshold).float() #二值化处理 if cfg.n_classes > 1: sub_cross_entropy = F.cross_entropy(pred.unsqueeze(dim=0), true_mask.unsqueeze(dim=0).squeeze(1)).item()#计算损失 else: sub_cross_entropy = dice_coeff(pred, true_mask.squeeze(dim=1)).item()#预测分割掩码和真实标签相似度,将两个结果转化为二值化的掩码,然后计算交集并集 tot_cross_entropy += sub_cross_entropy #计算总损失 tot_cross_entropy = tot_cross_entropy / len(masks_preds) #计算平均损失 tot += tot_cross_entropy #计算总平均损失 else: masks_pred = net(imgs) for true_mask, pred in zip(true_masks, masks_pred): pred = (pred > cfg.out_threshold).float() if cfg.n_classes > 1: tot += F.cross_entropy(pred.unsqueeze(dim=0), true_mask.unsqueeze(dim=0).squeeze(1)).item() else: tot += dice_coeff(pred, true_mask.squeeze(dim=1)).item() pbar.update(imgs.shape[0])

这段代码是语义分割任务中的损失计算部分,其中使用了深监督(Deep Supervision)的方法。在深监督中,一个模型通常会产生多个输出,每个输出都对应着不同的层或分支,在训练过程中,每个输出都会计算一次损失,并反向传播更新梯度。这个方法可以有效地加快模型的收敛速度,并提高模型的鲁棒性。 如果cfg.deepsupervision为True,表示使用深监督方法。代码首先使用网络net对输入图像imgs进行预测,得到多个预测掩码masks_pred。接下来,对于每一个预测掩码masks_pred,计算它与真实掩码true_masks之间的交叉熵损失或Dice系数损失,并将它们累加得到总的损失tot_cross_entropy。最后,将总的损失除以预测掩码的数量,得到平均损失tot_cross_entropy,并将它加到总平均损失tot中。 如果cfg.deepsupervision为False,表示不使用深监督方法。代码中仍然使用网络net对输入图像imgs进行预测,得到一个预测掩码masks_pred。接下来,计算它与真实掩码true_masks之间的交叉熵损失或Dice系数损失,并将它们累加得到总的损失tot。 最后,代码使用进度条pbar来显示训练的进度。其中pbar.update(imgs.shape[0])表示当前已经处理了多少张图片。

相关推荐

import os import random import numpy as np import cv2 import keras from create_unet import create_model img_path = 'data_enh/img' mask_path = 'data_enh/mask' # 训练集与测试集的切分 img_files = np.array(os.listdir(img_path)) data_num = len(img_files) train_num = int(data_num * 0.8) train_ind = random.sample(range(data_num), train_num) test_ind = list(set(range(data_num)) - set(train_ind)) train_ind = np.array(train_ind) test_ind = np.array(test_ind) train_img = img_files[train_ind] # 训练的数据 test_img = img_files[test_ind] # 测试的数据 def get_mask_name(img_name): mask = [] for i in img_name: mask_name = i.replace('.jpg', '.png') mask.append(mask_name) return np.array(mask) train_mask = get_mask_name(train_img) test_msak = get_mask_name(test_img) def generator(img, mask, batch_size): num = len(img) while True: IMG = [] MASK = [] for i in range(batch_size): index = np.random.choice(num) img_name = img[index] mask_name = mask[index] img_temp = os.path.join(img_path, img_name) mask_temp = os.path.join(mask_path, mask_name) temp_img = cv2.imread(img_temp) temp_mask = cv2.imread(mask_temp, 0)/255 temp_mask = np.reshape(temp_mask, [256, 256, 1]) IMG.append(temp_img) MASK.append(temp_mask) IMG = np.array(IMG) MASK = np.array(MASK) yield IMG, MASK # train_data = generator(train_img, train_mask, 32) # temp_data = train_data.__next__() # 计算dice系数 def dice_coef(y_true, y_pred): y_true_f = keras.backend.flatten(y_true) y_pred_f = keras.backend.flatten(y_pred) intersection = keras.backend.sum(y_true_f * y_pred_f) area_true = keras.backend.sum(y_true_f * y_true_f) area_pred = keras.backend.sum(y_pred_f * y_pred_f) dice = (2 * intersection + 1)/(area_true + area_pred + 1) return dice # 自定义损失函数,dice_loss def dice_coef_loss(y_true, y_pred): return 1 - dice_coef(y_true, y_pred) # 模型的创建 model = create_model() # 模型的编译 model.compile(optimizer='Adam', loss=dice_coef_loss, metrics=[dice_coef]) # 模型的训练 history = model.fit_generator(generator(train_img, train_mask, 4), steps_per_epoch=100, epochs=10, validation_data=generator(test_img, test_msak, 4), validation_steps=4 ) # 模型的保存 model.save('unet_model.h5') # 模型的读取 model = keras.models.load_model('unet_model.h5', custom_objects={'dice_coef_loss': dice_coef_loss, 'dice_coef': dice_coef}) # 获取测试数据 test_generator = generator(test_img, test_msak, 32) img, mask = test_generator.__next__() # 模型的测试 model.evaluate(img, mask) # [0.11458712816238403, 0.885412871837616] 94%

torch.save(model.state_dict(), r'./saved_model/' + str(args.arch) + '_' + str(args.batch_size) + '_' + str(args.dataset) + '_' + str(args.epoch) + '.pth') # 计算GFLOPs flops = 0 for name, module in model.named_modules(): if isinstance(module, torch.nn.Conv2d): flops += module.weight.numel() * 2 * module.in_channels * module.out_channels * module.kernel_size[ 0] * module.kernel_size[1] / module.stride[0] / module.stride[1] elif isinstance(module, torch.nn.Linear): flops += module.weight.numel() * 2 * module.in_features start_event = torch.cuda.Event(enable_timing=True) end_event = torch.cuda.Event(enable_timing=True) start_event.record() with torch.no_grad(): output = UNet(args,3,1).to(device) end_event.record() torch.cuda.synchronize() elapsed_time_ms = start_event.elapsed_time(end_event) gflops = flops / (elapsed_time_ms * 10 ** 6) print("GFLOPs: {:.2f}".format(gflops)) return best_iou, aver_iou, aver_dice, aver_hd, aver_accuracy, aver_recall, aver_precision, aver_f1score, aver_memory, fps, parameters, gflops出现错误 best_iou,aver_iou,aver_dice,aver_hd, aver_accuracy, aver_recall, aver_precision, aver_f1score, aver_memory, FPS, parameters, gflops = val(model,best_iou,val_dataloader) File "D:/BaiduNetdiskDownload/0605_ghostv2unet _tunnelcrack/ghostunet++/UNET++/main.py", line 143, in val return best_iou, aver_iou, aver_dice, aver_hd, aver_accuracy, aver_recall, aver_precision, aver_f1score, aver_memory, fps, parameters, gflops UnboundLocalError: local variable 'gflops' referenced before assignment怎么修改

最新推荐

recommend-type

麦肯锡-年月―中国xx集团战略咨询项目建议书.ppt

麦肯锡-年月―中国xx集团战略咨询项目建议书.ppt
recommend-type

廖倩5.14运营款.xlsx

廖倩5.14运营款.xlsx
recommend-type

setuptools-25.0.2-py2.py3-none-any.whl

文件操作、数据分析和网络编程等。Python社区提供了大量的第三方库,如NumPy、Pandas和Requests,极大地丰富了Python的应用领域,从数据科学到Web开发。Python库的丰富性是Python成为最受欢迎的编程语言之一的关键原因之一。这些库不仅为初学者提供了快速入门的途径,而且为经验丰富的开发者提供了强大的工具,以高效率、高质量地完成复杂任务。例如,Matplotlib和Seaborn库在数据可视化领域内非常受欢迎,它们提供了广泛的工具和技术,可以创建高度定制化的图表和图形,帮助数据科学家和分析师在数据探索和结果展示中更有效地传达信息。
recommend-type

全网第一个宝宝生活记录网站root ca

全网第一个宝宝生活记录网站,帮我写一个网站介绍,网址 https://43.136.21.175/ ,二维码分享和登录,统计记录最近时间,功能很全很实用,手机和电脑都可以访问,手机浏览器可以生成快捷方式到桌面和App一样,点右上角可以打开菜单,里面我做了图表统计可以看每天的喂养次数哪些,我们一直在用,很方便的
recommend-type

yes I can.mp3

yes I can.mp3
recommend-type

zigbee-cluster-library-specification

最新的zigbee-cluster-library-specification说明文档。
recommend-type

管理建模和仿真的文件

管理Boualem Benatallah引用此版本:布阿利姆·贝纳塔拉。管理建模和仿真。约瑟夫-傅立叶大学-格勒诺布尔第一大学,1996年。法语。NNT:电话:00345357HAL ID:电话:00345357https://theses.hal.science/tel-003453572008年12月9日提交HAL是一个多学科的开放存取档案馆,用于存放和传播科学研究论文,无论它们是否被公开。论文可以来自法国或国外的教学和研究机构,也可以来自公共或私人研究中心。L’archive ouverte pluridisciplinaire
recommend-type

实现实时数据湖架构:Kafka与Hive集成

![实现实时数据湖架构:Kafka与Hive集成](https://img-blog.csdnimg.cn/img_convert/10eb2e6972b3b6086286fc64c0b3ee41.jpeg) # 1. 实时数据湖架构概述** 实时数据湖是一种现代数据管理架构,它允许企业以低延迟的方式收集、存储和处理大量数据。与传统数据仓库不同,实时数据湖不依赖于预先定义的模式,而是采用灵活的架构,可以处理各种数据类型和格式。这种架构为企业提供了以下优势: - **实时洞察:**实时数据湖允许企业访问最新的数据,从而做出更明智的决策。 - **数据民主化:**实时数据湖使各种利益相关者都可
recommend-type

2. 通过python绘制y=e-xsin(2πx)图像

可以使用matplotlib库来绘制这个函数的图像。以下是一段示例代码: ```python import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt def func(x): return np.exp(-x) * np.sin(2 * np.pi * x) x = np.linspace(0, 5, 500) y = func(x) plt.plot(x, y) plt.xlabel('x') plt.ylabel('y') plt.title('y = e^{-x} sin(2πx)') plt.show() ``` 运行这段
recommend-type

JSBSim Reference Manual

JSBSim参考手册,其中包含JSBSim简介,JSBSim配置文件xml的编写语法,编程手册以及一些应用实例等。其中有部分内容还没有写完,估计有生之年很难看到完整版了,但是内容还是很有参考价值的。