使用R 语言先对数据框中某一列连续变量按照三等分转化为分类变量,再以每组的中位数进行赋值为新的一列分类变量,最后基于COX模型进行对这列新的分类变量计算其P for trend
时间: 2024-02-22 09:58:13 浏览: 75
用R语言进行数据分析入门教程(一)
您可以使用R语言中的dplyr包和Hmisc包来对数据框中的某一列连续变量进行三等分转化为分类变量。然后,使用dplyr包中的mutate()函数和Hmisc包中的cut2()函数将每组的中位数作为新的分类变量的值。最后,使用survival包中的coxph()函数和coxphtest()函数基于COX模型计算P for trend。示例代码如下:
```R
# 加载所需的包
library(dplyr)
library(Hmisc)
library(survival)
# 将数据框按照某一列连续变量的值进行三等分转化为分类变量
your_data <- your_data %>%
mutate(column_cut = cut2(COLUMN, g = 3))
# 计算每组的中位数
medians <- your_data %>%
group_by(column_cut) %>%
summarize(median_value = median(COLUMN))
# 将每组的中位数作为新的分类变量的值
your_data <- your_data %>%
left_join(medians, by = "column_cut") %>%
mutate(new_category = median_value)
# 拟合COX模型并计算P for trend
cox_model <- coxph(Surv(time, event) ~ new_category, data = your_data)
trend_test <- coxphtest(cox_model, ~ new_category)
trend_p <- trend_test$chisq[2]
```
请注意,您需要将示例代码中的"your_data"和"COLUMN"替换为您自己的数据框和列名称。
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