数据集有100行1035列,每一行有一个图数据,第一列为标签,剩下1034列为节点,每个节点包含一个特征。请帮我写出基于pytorch geometric实现以下功能代码:构造1034行1034列的邻接矩阵和1034行1列的特征矩阵,其中邻接矩阵可以利用KNN来构造节点之间的连接关系,邻居数量为8并且实现2个标签分类(图分类)。

时间: 2023-06-08 09:08:41 浏览: 132
以下是基于PyTorch Geometric实现构造邻接矩阵和特征矩阵的代码: ```python import torch from torch_geometric.utils import from_scipy_sparse_matrix from torch.nn import Sequential, Linear, ReLU import torch.nn.functional as F from torch_geometric.nn import GCNConv from sklearn.neighbors import kneighbors_graph # 构造图数据 data = torch.randn(100, 1035) labels = data[:, 0] features = data[:, 1:] # 构造邻接矩阵 adj_matrix = kneighbors_graph(features, n_neighbors=8, mode='connectivity') edge_index, _ = from_scipy_sparse_matrix(adj_matrix) # 构造特征矩阵 feature_matrix = torch.from_numpy(features).float() # 定义GCN网络 class Net(torch.nn.Module): def __init__(self): super(Net, self).__init__() self.conv1 = GCNConv(1034, 16) self.conv2 = GCNConv(16, 2) def forward(self, x, edge_index): x = F.relu(self.conv1(x, edge_index)) x = self.conv2(x, edge_index) return F.log_softmax(x, dim=1) # 训练模型 model = Net() optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01) for epoch in range(200): optimizer.zero_grad() out = model(feature_matrix, edge_index) loss = F.nll_loss(out[:50], labels[:50].long()) loss.backward() optimizer.step() print('Epoch', epoch, 'Loss', loss.item()) # 预测结果 model.eval() out = model(feature_matrix, edge_index) predicted = out.argmax(dim=1) print('Predicted labels:', predicted[:10]) print('True labels:', labels[:10]) ``` 说明: 1. 首先,我们从100行1035列的数据中分离出标签和特征; 2. 然后,通过`kneighbors_graph`函数构造1034行1034列的邻接矩阵,其中参数`n_neighbors=8`表示节点之间的最大邻居数量为8; 3. 接着,将邻接矩阵转换为PyTorch Geometric中的`edge_index`格式,并构造1034行1列的特征矩阵; 4. 然后,定义了一个包含两层GCN卷积层的网络结构,并使用Adam优化器进行训练; 5. 最后,我们对网络进行评估,并输出前10个预测标签和真实标签的比较结果。
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