为我编写一个lammps的势函数文件,用来定义碳原子、氢原子、氧原子、氮原子四种原子相互作用所有可能出现的力场

时间: 2023-07-10 07:08:50 浏览: 55
下面是一个示例lammps的势函数文件,用来定义碳原子、氢原子、氧原子、氮原子四种原子相互作用所有可能出现的力场。这个文件包括了碳-碳、碳-氢、碳-氧、碳-氮、氢-氢、氢-氧、氢-氮、氧-氧、氧-氮之间的相互作用。 ``` # Carbon-Hydrogen interaction pair_style lj/cut/coul/long 10.0 10.0 pair_coeff 1 2 0.046 3.4 pair_coeff 2 2 0.02 2.5 # Carbon-Oxygen interaction pair_style lj/cut/coul/long 10.0 10.0 pair_coeff 1 3 0.075 3.2 pair_coeff 2 3 0.055 3.0 pair_coeff 3 3 0.02 2.8 # Carbon-Nitrogen interaction pair_style lj/cut/coul/long 10.0 10.0 pair_coeff 1 4 0.095 3.0 pair_coeff 2 4 0.085 2.8 pair_coeff 3 4 0.065 2.6 pair_coeff 4 4 0.03 2.4 # Hydrogen-Hydrogen interaction pair_style lj/cut/coul/long 10.0 10.0 pair_coeff 2 2 0.015 2.5 # Hydrogen-Oxygen interaction pair_style lj/cut/coul/long 10.0 10.0 pair_coeff 2 3 0.045 3.0 # Hydrogen-Nitrogen interaction pair_style lj/cut/coul/long 10.0 10.0 pair_coeff 2 4 0.065 2.6 # Oxygen-Oxygen interaction pair_style lj/cut/coul/long 10.0 10.0 pair_coeff 3 3 0.1 3.0 # Oxygen-Nitrogen interaction pair_style lj/cut/coul/long 10.0 10.0 pair_coeff 3 4 0.095 2.8 # Nitrogen-Nitrogen interaction pair_style lj/cut/coul/long 10.0 10.0 pair_coeff 4 4 0.13 2.6 ``` 在这个文件中,我们使用了Lennard-Jones和Coulomb相互作用来描述原子之间的相互作用。其中,`pair_style`命令用于选择势函数类型,`pair_coeff`命令用于设置参数。在上面的示例中,我们使用了长程库伦相互作用和截断Lennard-Jones势函数,截断距离为10.0,Lennard-Jones参数和Coulomb参数在每个`pair_coeff`命令中设置。 在实际使用时,您需要根据您的具体情况对上述示例进行修改。

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好的,根据上面的目标函数,我们可以推导出其对应的梯度向量函数,如下所示: def gradient(x, y, beta): """ Compute gradient of the logistic regression loss function :param beta: model parameter vector :param x: feature matrix :param y: label vector :return: gradient vector """ n = x.shape[0] pred = 1 /
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