我有一个模型,包含了聚乙烯分子链和碳纳米管,请编写一个lammps的势函数用来模拟这个模型原子间的相互作用
时间: 2024-02-03 14:13:12 浏览: 133
为了模拟聚乙烯分子链和碳纳米管之间的相互作用,我们需要定义一个势函数,可以在LAMMPS中使用。以下是一个可能的势函数:
```
# LAMMPS pair_style command
pair_style hybrid lj/cut/coul/long 10.0 12.0 10.0 12.0 0.0 0.0 12.0 12.0 harmonic
# LAMMPS pair_coeff command
pair_coeff * * lj/cut/coul/long 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
pair_coeff 1 1 lj/cut/coul/long 0.1504 3.405 10.0 12.0
pair_coeff 2 2 lj/cut/coul/long 0.055 3.3 10.0 12.0
pair_coeff 1 2 harmonic 100.0 1.524
# LAMMPS bond_style command
bond_style harmonic
# LAMMPS bond_coeff command
bond_coeff 1 500.0 1.54
# LAMMPS atom_style command
atom_style full
# LAMMPS atom_type command
atom_type 1 bond
atom_type 2 angle
# LAMMPS mass command
mass 1 12.011
mass 2 1.008
# LAMMPS group command
group carbon type 1
group hydrogen type 2
# LAMMPS pair_modify command
pair_modify mix arithmetic
# LAMMPS neighbor command
neighbor 2.0 bin
# LAMMPS neigh_modify command
neigh_modify every 1 delay 0 check yes
# LAMMPS fix command
fix 1 all nve
fix 2 carbon setforce 0.0 0.0 0.0
fix 3 hydrogen setforce 0.0 0.0 0.0
# LAMMPS run command
run 10000
# LAMMPS unfix command
unfix 1
unfix 2
unfix 3
```
在上述代码中,我们使用了`hybrid`势函数,组合了Lennard-Jones和Coulomb势函数以及一个弹性键势函数。其中,碳原子被定义为类型1,氢原子被定义为类型2。Lennard-Jones和Coulomb势函数的参数可以根据需要进行调整。弹性键势函数的参数也可以根据需要进行调整。
在运行LAMMPS模拟之前,需要使用`pair_coeff`命令设置Lennard-Jones和Coulomb势函数的参数,使用`bond_coeff`命令设置弹性键势函数的参数。还需要使用`atom_type`和`mass`命令定义原子类型和原子质量。
在模拟过程中,我们使用了`fix`命令将所有原子的速度初始化为零,并使用`run`命令运行模拟。最后,我们使用`unfix`命令取消所有修复操作。
这只是一个简单的例子,具体的势函数和参数需要根据模拟的具体情况进行调整。
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