我有一个模型,包含了聚乙烯分子链和碳纳米管,请编写一个lammps的势函数用来模拟这个模型原子间的相互作用

时间: 2024-02-03 11:13:12 浏览: 20
为了模拟聚乙烯分子链和碳纳米管之间的相互作用,我们需要定义一个势函数,可以在LAMMPS中使用。以下是一个可能的势函数: ``` # LAMMPS pair_style command pair_style hybrid lj/cut/coul/long 10.0 12.0 10.0 12.0 0.0 0.0 12.0 12.0 harmonic # LAMMPS pair_coeff command pair_coeff * * lj/cut/coul/long 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 pair_coeff 1 1 lj/cut/coul/long 0.1504 3.405 10.0 12.0 pair_coeff 2 2 lj/cut/coul/long 0.055 3.3 10.0 12.0 pair_coeff 1 2 harmonic 100.0 1.524 # LAMMPS bond_style command bond_style harmonic # LAMMPS bond_coeff command bond_coeff 1 500.0 1.54 # LAMMPS atom_style command atom_style full # LAMMPS atom_type command atom_type 1 bond atom_type 2 angle # LAMMPS mass command mass 1 12.011 mass 2 1.008 # LAMMPS group command group carbon type 1 group hydrogen type 2 # LAMMPS pair_modify command pair_modify mix arithmetic # LAMMPS neighbor command neighbor 2.0 bin # LAMMPS neigh_modify command neigh_modify every 1 delay 0 check yes # LAMMPS fix command fix 1 all nve fix 2 carbon setforce 0.0 0.0 0.0 fix 3 hydrogen setforce 0.0 0.0 0.0 # LAMMPS run command run 10000 # LAMMPS unfix command unfix 1 unfix 2 unfix 3 ``` 在上述代码中,我们使用了`hybrid`势函数,组合了Lennard-Jones和Coulomb势函数以及一个弹性键势函数。其中,碳原子被定义为类型1,氢原子被定义为类型2。Lennard-Jones和Coulomb势函数的参数可以根据需要进行调整。弹性键势函数的参数也可以根据需要进行调整。 在运行LAMMPS模拟之前,需要使用`pair_coeff`命令设置Lennard-Jones和Coulomb势函数的参数,使用`bond_coeff`命令设置弹性键势函数的参数。还需要使用`atom_type`和`mass`命令定义原子类型和原子质量。 在模拟过程中,我们使用了`fix`命令将所有原子的速度初始化为零,并使用`run`命令运行模拟。最后,我们使用`unfix`命令取消所有修复操作。 这只是一个简单的例子,具体的势函数和参数需要根据模拟的具体情况进行调整。

相关推荐

最新推荐

recommend-type

lammps-reaxff-机器学习-电化学.pdf

Lammps-ReaxFF燃烧过程模拟和分析、化学摩擦过程(CMP)过程模拟与结果分析、溶液中的质子转移、碳化硅表面石墨烯的生长 【comsol电化学】 燃料电池、多孔电极、尘气输运、纽扣电池、直接碳燃料电池模型(传质-导电-...
recommend-type

lammps实例3.pdf

lammps运行示例3,一般性分子模拟软件。 兼容当前大多数的势能模型,编程水平高,计算效率高。可以 模拟软材料和固体物理系统。
recommend-type

lammps实例2.pdf

lammps运行示例2,一般性分子模拟软件。 兼容当前大多数的势能模型,编程水平高,计算效率高。可以 模拟软材料和固体物理系统。
recommend-type

lammps实例1.pdf

lammps运行示例,一般性分子模拟软件。兼容当前大多数的势能模型,编程水平高,计算效率高。可以模拟软材料和固体物理系统。
recommend-type

RTL8188FU-Linux-v5.7.4.2-36687.20200602.tar(20765).gz

REALTEK 8188FTV 8188eus 8188etv linux驱动程序稳定版本, 支持AP,STA 以及AP+STA 共存模式。 稳定支持linux4.0以上内核。
recommend-type

管理建模和仿真的文件

管理Boualem Benatallah引用此版本:布阿利姆·贝纳塔拉。管理建模和仿真。约瑟夫-傅立叶大学-格勒诺布尔第一大学,1996年。法语。NNT:电话:00345357HAL ID:电话:00345357https://theses.hal.science/tel-003453572008年12月9日提交HAL是一个多学科的开放存取档案馆,用于存放和传播科学研究论文,无论它们是否被公开。论文可以来自法国或国外的教学和研究机构,也可以来自公共或私人研究中心。L’archive ouverte pluridisciplinaire
recommend-type

:YOLOv1目标检测算法:实时目标检测的先驱,开启计算机视觉新篇章

![:YOLOv1目标检测算法:实时目标检测的先驱,开启计算机视觉新篇章](https://img-blog.csdnimg.cn/img_convert/69b98e1a619b1bb3c59cf98f4e397cd2.png) # 1. 目标检测算法概述 目标检测算法是一种计算机视觉技术,用于识别和定位图像或视频中的对象。它在各种应用中至关重要,例如自动驾驶、视频监控和医疗诊断。 目标检测算法通常分为两类:两阶段算法和单阶段算法。两阶段算法,如 R-CNN 和 Fast R-CNN,首先生成候选区域,然后对每个区域进行分类和边界框回归。单阶段算法,如 YOLO 和 SSD,一次性执行检
recommend-type

ActionContext.getContext().get()代码含义

ActionContext.getContext().get() 是从当前请求的上下文对象中获取指定的属性值的代码。在ActionContext.getContext()方法的返回值上,调用get()方法可以获取当前请求中指定属性的值。 具体来说,ActionContext是Struts2框架中的一个类,它封装了当前请求的上下文信息。在这个上下文对象中,可以存储一些请求相关的属性值,比如请求参数、会话信息、请求头、应用程序上下文等等。调用ActionContext.getContext()方法可以获取当前请求的上下文对象,而调用get()方法可以获取指定属性的值。 例如,可以使用 Acti
recommend-type

c++校园超市商品信息管理系统课程设计说明书(含源代码) (2).pdf

校园超市商品信息管理系统课程设计旨在帮助学生深入理解程序设计的基础知识,同时锻炼他们的实际操作能力。通过设计和实现一个校园超市商品信息管理系统,学生掌握了如何利用计算机科学与技术知识解决实际问题的能力。在课程设计过程中,学生需要对超市商品和销售员的关系进行有效管理,使系统功能更全面、实用,从而提高用户体验和便利性。 学生在课程设计过程中展现了积极的学习态度和纪律,没有缺勤情况,演示过程流畅且作品具有很强的使用价值。设计报告完整详细,展现了对问题的深入思考和解决能力。在答辩环节中,学生能够自信地回答问题,展示出扎实的专业知识和逻辑思维能力。教师对学生的表现予以肯定,认为学生在课程设计中表现出色,值得称赞。 整个课程设计过程包括平时成绩、报告成绩和演示与答辩成绩三个部分,其中平时表现占比20%,报告成绩占比40%,演示与答辩成绩占比40%。通过这三个部分的综合评定,最终为学生总成绩提供参考。总评分以百分制计算,全面评估学生在课程设计中的各项表现,最终为学生提供综合评价和反馈意见。 通过校园超市商品信息管理系统课程设计,学生不仅提升了对程序设计基础知识的理解与应用能力,同时也增强了团队协作和沟通能力。这一过程旨在培养学生综合运用技术解决问题的能力,为其未来的专业发展打下坚实基础。学生在进行校园超市商品信息管理系统课程设计过程中,不仅获得了理论知识的提升,同时也锻炼了实践能力和创新思维,为其未来的职业发展奠定了坚实基础。 校园超市商品信息管理系统课程设计的目的在于促进学生对程序设计基础知识的深入理解与掌握,同时培养学生解决实际问题的能力。通过对系统功能和用户需求的全面考量,学生设计了一个实用、高效的校园超市商品信息管理系统,为用户提供了更便捷、更高效的管理和使用体验。 综上所述,校园超市商品信息管理系统课程设计是一项旨在提升学生综合能力和实践技能的重要教学活动。通过此次设计,学生不仅深化了对程序设计基础知识的理解,还培养了解决实际问题的能力和团队合作精神。这一过程将为学生未来的专业发展提供坚实基础,使其在实际工作中能够胜任更多挑战。
recommend-type

"互动学习:行动中的多样性与论文攻读经历"

多样性她- 事实上SCI NCES你的时间表ECOLEDO C Tora SC和NCESPOUR l’Ingén学习互动,互动学习以行动为中心的强化学习学会互动,互动学习,以行动为中心的强化学习计算机科学博士论文于2021年9月28日在Villeneuve d'Asq公开支持马修·瑟林评审团主席法布里斯·勒菲弗尔阿维尼翁大学教授论文指导奥利维尔·皮耶昆谷歌研究教授:智囊团论文联合主任菲利普·普雷教授,大学。里尔/CRISTAL/因里亚报告员奥利维耶·西格德索邦大学报告员卢多维奇·德诺耶教授,Facebook /索邦大学审查员越南圣迈IMT Atlantic高级讲师邀请弗洛里安·斯特鲁布博士,Deepmind对于那些及时看到自己错误的人...3谢谢你首先,我要感谢我的两位博士生导师Olivier和Philippe。奥利维尔,"站在巨人的肩膀上"这句话对你来说完全有意义了。从科学上讲,你知道在这篇论文的(许多)错误中,你是我可以依