如何在lammps的in文件中添加定义原子间作用力的oplsaa力场数据
时间: 2024-02-03 11:13:05 浏览: 330
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要在 LAMMPS 输入文件中添加 OPLS-AA 力场数据,需要进行以下步骤:
1. 定义原子类型:首先,在 LAMMPS 输入文件中定义原子类型。例如:
```
pair_style lj/cut 10.0
pair_coeff * * 1.0 1.0
atom_style full
read_data datafile
# Define atom types
# type mass charge type name
mass 1 12.0110 # C
mass 2 1.0080 # H
```
在这个例子中,我们定义了两种原子类型:C 和 H。
2. 导入 OPLS-AA 力场参数:接下来,需要在 LAMMPS 输入文件中导入 OPLS-AA 力场参数。这可以通过使用 `pair_coeff` 命令实现。例如:
```
pair_style opls 2.5
pair_coeff * * oplsaa.prm C H
```
其中,`oplsaa.prm` 是包含 OPLS-AA 力场参数的文件。在这个例子中,我们将 C 和 H 原子类型的参数导入。
3. 定义分子:最后,需要在 LAMMPS 输入文件中定义分子。例如:
```
# Define molecule
group mol type 1 2
fix 1 mol rigid/nve molecule
```
在这个例子中,我们定义了一个由 C 和 H 原子组成的分子,并使用 `fix` 命令将该分子定义为刚性体。
有了这些步骤,你就可以在 LAMMPS 输入文件中添加 OPLS-AA 力场数据了。
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