Nomo <- nomogram(svm, fun = function(x) + predict(svm, x, probability = TRUE)[, 2], funlabel = "Risk of SVM") Error in lims[[i]] : subscript out of bounds
时间: 2024-01-20 07:02:32 浏览: 164
二维vector,clear()操作请慎重,当心遇到vector subscript out of range问题
在这段代码中,出现了一个错误,错误信息是“subscript out of bounds”。这个错误通常是由于尝试访问一个向量或列表的不存在的元素而导致的。
在这个具体的代码中,可能是因为lims参数设置出现了问题,导致了这个错误。lims参数用于指定诺莫图中每个变量的取值范围,在设置时需要注意格式和长度。
可以尝试修改代码,检查lims参数的设置是否正确,如下所示:
```R
# 创建一个SVM模型
data <- iris
data$Species <- ifelse(data$Species == "versicolor", "versicolor/virginica", data$Species)
svm <- svm(Species ~ ., data = data, probability = TRUE)
# 生成诺莫图
Nomo <- nomogram(svm, fun = function(x) predict(svm, x, probability = TRUE)[, 2], funlabel = "Risk of SVM", lp=TRUE, se.fit=FALSE, yscale=0.5)
# 设置lims参数
lims <- list(Age = c(0, 100),
Sex = c(0, 1),
Race = c(0, 1),
# ...其他变量的取值范围
DXlung = c(0, 1))
# 绘制诺莫图
plot(Nomo, cex.axis = 0.8, col.grid = "gray", col.lines = "darkgray", col.text = "black", lty.grid = 1, lims = lims)
```
在这个修改后的代码中,lims参数被设置为一个列表,其中每个元素是一个向量,表示对应变量的取值范围。需要确保lims参数的长度与诺莫图中的变量个数相匹配。同时,注意lp和se.fit参数的设置,根据实际需要进行调整。
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