pca降维根据贡献率代码matlab
时间: 2023-05-14 13:02:31 浏览: 101
PCA(Principal Component Analysis)是一种常见的特征提取和降维技术,可以将高维数据转换成低维数据。在PCA中,通常会根据贡献率来选择保留的主成分数量。下面给出一个简单的MATLAB代码示例来实现PCA降维。
假设我们有一个$n \times d$的数据矩阵X,其中$n$表示样本数量,$d$表示特征数。我们想将其降维到$k(<d)$维。
首先,我们需要进行零均值化处理,即对每个特征减去其均值。代码如下:
```matlab
X_mean = mean(X, 1);
X_std = std(X, 1);
X_norm = (X - X_mean)./X_std;
```
然后,我们可以计算出数据的协方差矩阵$C$,并对其进行特征值分解:
```matlab
C = X_norm' * X_norm ./ n;
[~, S, V] = svd(C);
```
其中,$S$是一个$d \times d$的对角矩阵,对角线上的元素是特征值,$V$是$d \times d$的正交矩阵,每列是对应的特征向量。
接下来,我们可以根据贡献率来选择保留的主成分数量$k$。通常,我们希望保留的主成分可以解释数据方差的大部分。下面的代码可以计算出每个主成分贡献的方差比例:
```matlab
s = diag(S);
variance_ratio = cumsum(s)./sum(s);
```
其中,$s$是特征值的向量,$variance\_ratio$是每个主成分解释的方差比例累积和的向量。
最后,我们可以根据所选的主成分数量$k$,计算出转换矩阵$W$,并对数据进行投影:
```matlab
W = V(:, 1:k);
X_pca = X_norm * W;
```
这里,$W$是$d \times k$的矩阵,每一列是一个主成分对应的特征向量。$X\_pca$是$n \times k$的矩阵,每行是一个样本在主成分上的投影。
完整的PCA降维代码如下:
```matlab
X_mean = mean(X, 1);
X_std = std(X, 1);
X_norm = (X - X_mean)./X_std;
C = X_norm' * X_norm ./ n;
[~, S, V] = svd(C);
s = diag(S);
variance_ratio = cumsum(s)./sum(s);
k = find(variance_ratio>=0.9, 1);
W = V(:, 1:k);
X_pca = X_norm * W;
```
这个代码中,我们选择保留的主成分数量是解释数据方差90%以上的最少数量。
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