idx name nseq alen mlen W eff_nseq re/pos description #---- -------------------- ----- ----- ----- ----- -------- ------ ----------- 1 PRRSV 1554 17866 15121 17243 3.26 0.620

这是 HMMER 的 hmmscan 命令输出结果的一部分，显示了检索结果的信息。具体来说，这部分输出包括以下内容：

- idx：表示序列的索引号，从 1 开始递增。
- name：表示序列的名称或标识符。
- nseq：表示序列的数目。
- alen：表示序列的长度，即对齐之后的长度。
- mlen：表示序列的模型匹配长度。
- W：表示搜索使用的窗口大小。
- eff_nseq：表示有效序列数目，即考虑到序列之间的相似性而计算的序列数目。
- re/pos：表示匹配的相对熵/位点相对熵。
- description：表示序列的描述信息或注释。

根据这些信息，可以对序列的匹配情况进行初步的了解和分析。其中，mlen 和 eff_nseq 是比较重要的指标，可以用来评估序列与模型的匹配程度。