Error: unexpected symbol in "add_zongjia_column <- function(data) { zongjia <- data[["shuliang"]] * data[["hsje"]] data"

这个错误提示表明在函数定义中有一个意外的符号，可能是少了或多了一些引号、括号等等。在这种情况下，我们需要检查函数定义的语法是否正确。

在这个特定的函数定义中，我们可以看到以下错误：

zongjia <- data[["shuliang"]] * data[["hsje"]]

这里的问题在于`[[`操作符内部的引号没有被正确地转义。在R中，双引号通常用于表示字符串，因此如果我们想在字符串中包含一个双引号，我们需要使用`\`进行转义。因此，正确的函数定义应该是：

add_zongjia_column <- function(data) {
  zongjia <- data[["shuliang"]] * data[["hsje"]]
  data$zongjia <- zongjia
  return(data)
}

请注意，这里的`[[`操作符内部的引号已经正确地转义了，因此函数定义中再次出现了这个错误的概率较小。

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Error: unexpected symbol in "metadata_pair <- metadata_pair[metadata_pair$TCGA_id !=TCGA-44-3917-01B"

这个错误通常是因为在代码中使用了无效的符号。在这种情况下，是因为“-”符号没有被正确地引用。请尝试将“-”符号改为下划线“_”或使用引号将其括起来，例如：

metadata_pair <- metadata_pair[metadata_pair$TCGA_id != "TCGA-44-3917-01B"]

或者

metadata_pair <- metadata_pair[metadata_pair$TCGA_id != TCGA_44_3917_01B]

Error: unexpected symbol in: "bca_out_dat <- extract_outcome_data(snps = asm_exp_dat$SNP, outcomes = 'ieu-a-1127' bca_out"

这个错误是因为在代码行末尾缺少逗号或分号，导致R无法正确解析该行代码。你需要检查该行代码，并确保语法正确。在这行代码中，你漏掉了逗号，应该是这样的：

bca_out_dat <- extract_outcome_data(snps = asm_exp_dat$SNP, outcomes = 'ieu-a-1127', bca_out)

请注意，我在 `outcomes` 和 `bca_out` 参数之间添加了逗号。