在R语言中建立ergm模型,参照分布项设置为泊松分布,引入关键的包,对模型分别使用MH采样函数以及Gibbs采样函数下的MCMC算法进行参数估计,并绘制后验密度、迭代轨迹、自相关图像
时间: 2024-02-03 14:14:17 浏览: 103
建立ERGM模型并设置分布项为泊松分布:
```R
library(statnet)
library(ergm)
# 读入数据
data("sampson")
# 建立ERGM模型
model <- ergm(sampson ~ edges + mutual,
control = list(maxit = 1000),
response = "edges")
# 设置分布项为泊松分布
model <- set.edgecov.mat(model, matrix(1, ncol = 1))
model <- update(model, formula = ~edges + mutual + edgecov("1"))
# 查看模型信息
summary(model)
```
使用MH采样函数下的MCMC算法进行参数估计:
```R
# 使用MH采样函数进行参数估计
set.seed(123)
mcmc1 <- mcmc(model, n = 5000, method = "MH", control = list(burnin = 1000))
# 绘制后验密度
plot(density(mcmc1 ~ edges))
# 绘制迭代轨迹
plot(mcmc1 ~ edges, type = "l")
# 绘制自相关图像
plot(mcmc1, type = "acf")
```
使用Gibbs采样函数下的MCMC算法进行参数估计:
```R
# 使用Gibbs采样函数进行参数估计
set.seed(123)
mcmc2 <- mcmc(model, n = 5000, method = "Gibbs", control = list(burnin = 1000))
# 绘制后验密度
plot(density(mcmc2 ~ edges))
# 绘制迭代轨迹
plot(mcmc2 ~ edges, type = "l")
# 绘制自相关图像
plot(mcmc2, type = "acf")
```
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