pca = PCA(n_components=7) newX = pca.fit_transform(X) x_data = ['PC1','PC2','PC3','PC4','PC5','PC6','PC7'] y_data = np.around(pca.explained_variance_ratio_, 2) plt.bar(x=x_data, height=y_data,color='steelblue', alpha=0.8) plt.show() 上述代码是对数据进行主成分分析，展示每个主成分的贡献率，请在上述代码基础上，请给出下一步的代码，要求是： 计算所有主成分之间的皮尔逊相关系数，并用热图Heatmap的形式展示出来

时间: 2023-06-05 20:04:57 浏览: 121
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pca954x.rar_I2C switch_V2 _pca954x

import pandas as pd import seaborn as sns # 转换主成分数据为DataFrame PCA_data = pd.DataFrame(newX, columns=['PC1', 'PC2', 'PC3', 'PC4', 'PC5', 'PC6', 'PC7']) # 计算主成分之间的皮尔逊相关系数 correlation_matrix = PCA_data.corr() # 用热图展示相关系数 sns.heatmap(correlation_matrix, cmap='coolwarm', annot=True) plt.show()
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pca = PCA(n_components=0.9) # 保持90%的信息 new_train_pca = pca.fit_transform(train_data_scaler.iloc[:,0:-1]) new_test_pca = pca.fit_transform(test_data_scaler) pca = PCA(n_components=16) new_train_pca_16 = pca.fit_transform(train_data_scaler.iloc[:,0:-1]) new_train_pca_16 = pd.DataFrame(new_train_pca_16) new_test_pca_16 = pca.fit_transform(test_data_scaler) new_test_pca_16 = pd.DataFrame(new_test_pca_16) new_train_pca_16['target']=train_data_scaler['target']

首先，通过PCA(n_components=0.9)来定义一个PCA对象，将其n_components参数设置为0.9，表示要将数据降到原来的90%信息量。然后，分别对训练集和测试集进行PCA降维，降维后的结果分别保存在new_train_pca和new_test_...

pca=PCA(n_components=1) pca.fit(X1_scaled) X1_pca=pca.transform(X1_scaled) pca.fit(X2_scaled) X2_pca=pca.transform(X1_scaled) pca.fit(X3_scaled) X3_pca=pca.transform(X3_scaled) pca.fit(X4_scaled) X4_pca=pca.transform(X4_scaled) pca.fit(X5_scaled) X5_pca=pca.transform(X5_scaled) pca.fit(X6_scaled) X6_pca=pca.transform(X6_scaled) pca.fit(X7_scaled) X7_pca=pca.transform(X7_scaled) pca.fit(X8_scaled) X8_pca=pca.transform(X8_scaled) pca.fit(X9_scaled) X9_pca=pca.transform(X9_scaled) pca.fit(X10_scaled) X10_pca=pca.transform(X10_scaled) pca.fit(X11_scaled) X11_pca=pca.transform(X11_scaled) pca.fit(X12_scaled) X12_pca=pca.transform(X12_scaled) pca.fit(X13_scaled) X13_pca=pca.transform(X13_scaled) pca.fit(X14_scaled) X14_pca=pca.transform(X14_scaled) pca.fit(X15_scaled) X15_pca=pca.transform(X15_scaled) #生成变量 X1_new = X1_pca X2_new = X2_pca X3_new = X3_pca X4_new = X4_pca X5_new = X5_pca X6_new = X6_pca X7_new = X7_pca X8_new = X8_pca X9_new = X9_pca X10_new = X10_pca X11_new = X11_pca X12_new = X12_pca X13_new = X13_pca X14_new = X14_pca X15_new = X15_pca，如何让这15个变量做支持向量机预测

clf.fit(X_train, y_train) # 预测测试集结果 y_pred = clf.predict(X_test) 在上面的示例代码中，我们首先将15个变量组合成一个特征矩阵X。然后，我们使用train_test_split函数将数据集划分为训练集和测试...

pca = PCA(n_components=2) X_pca = pca.fit_transform(pred_images)，如何用散点图可视化啊

要使用散点图可视化降维后的数据，你可以将降维后的数据X_pca作为横纵坐标，然后使用散点图函数进行绘制。 以下是一个示例代码： python import matplotlib.pyplot as plt # 绘制散点图 plt.scatter(X_pca[:...

import pandas as pd from sklearn.preprocessing import StandardScaler from sklearn.decomposition import PCA file_path = r'E:\XuJunjie\Dasanxia\大数据实验\实验3\实验三\1. 城市排名.txt' data = pd.read_csv(file_path,sep=',') X = data.values.reshape(-1,1) scaler = StandardScaler() X_scaled = scaler.fit_transform(X) pca = PCA(n_components=2) X_pca = pca.fit_transform(X_scaled) print(pca.components_) print(pca.explained_variance_ratio_)

这段代码是用Python中的pandas库读取一个...接着使用PCA方法对标准化后的数据进行降维处理，将其降到2维，即将原来的数据压缩到一个二维的平面内。最后输出了降维后的主成分（即特征向量）和每个主成分所占的方差比例。

n_components = 16 pca = PCA(n_components=n_components, svd_solver='randomized',whiten=True).fit(X_train) X_train_pca = pca.transform(X_train)

2. pca = PCA(n_components=n_components, svd_solver='randomized',whiten=True).fit(X_train)：创建一个PCA对象，并将其应用于训练数据X_train上进行拟合。其中，n_components指定了PCA算法将数据降到的维度，svd_...

import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.preprocessing import StandardScaler from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.cluster import KMeans from scipy.spatial import Voronoi, voronoi_plot_2d # 生成示例数据 data = df.iloc[:,1:15] # 标准化处理 scaler = StandardScaler() data_scaled = scaler.fit_transform(data) # 主成分分析 pca = PCA(n_components=5) data_pca = pca.fit_transform(data_scaled) # 聚类分析 kmeans = KMeans(n_clusters=3) kmeans.fit(data_pca) labels = kmeans.labels_ centers = kmeans.cluster_centers_ # 绘制Voronoi图 vor = Voronoi(centers) voronoi_plot_2d(vor) # 绘制样本点 plt.scatter(data_pca[:, 0], data_pca[:, 1], c=labels) # 设置坐标轴标签和标题 plt.xlabel('PC1') plt.ylabel('PC2') plt.title('Voronoi Diagram') # 显示图形 plt.show()

data_pca = pca.fit_transform(data_scaled) # 聚类分析 kmeans = KMeans(n_clusters=3) kmeans.fit(data_pca) labels = kmeans.labels_ centers = kmeans.cluster_centers_ # 将主成分投影回原始数据空间 data_...

解释pca = PCA(n_components = 2) #训练数据 x=pca.fit_transform(df.values)

1. PCA(n_components = 2)：创建一个PCA模型，其中n_components参数指定将数据降到2维。 2. pca.fit_transform(df.values)：对数据df.values进行训练并执行降维操作，返回降维后的数据。其中fit_transform...

# 读取数据集 data = pd.read_csv('./ebs/waveform-5000.csv') epsilon = 1e-10 # 去除第一行数据（属性名称） data = data.iloc[1:] # 提取属性列和类别列 X = data.iloc[:, :-1].values.astype(float) #x表示属性 y_true = data.iloc[:, -1].values #y表示类别，最后一列 # 数据标准化 scaler = MinMaxScaler(feature_range=(0, 1)) X_scaled = scaler.fit_transform(X) # 初始化NMF模型 n_components = range(2, 20) # 不同的n_components值 silhouette_scores = [] # 存储每个n_components的轮廓系数 best_silhouette_score = -1 best_n_components = -1 # 对不同的n_components进行迭代 for n in n_components: nmf = NMF(n_components=n) features = nmf.fit_transform(X_scaled) labels = nmf.transform(X_scaled).argmax(axis=1) # labels2 = nmf.components_.argmax(axis=1) # 根据聚类结果计算轮廓系数 # silhouette_avg = silhouette_score(X_scaled, labels) silhouette_avg = calinski_harabasz_score(X_scaled, labels) silhouette_scores.append(silhouette_avg) print(f"n_components={n}: Silhouette Score = {silhouette_avg}") # 选择最佳的n_components if silhouette_avg > best_silhouette_score: best_silhouette_score = silhouette_avg best_n_components = n print(f"best n_components = {best_n_components}") # 绘制得分图 plt.plot(n_components, silhouette_scores, marker='o') plt.title("NMF Clustering Performance") plt.xlabel("n_components") plt.ylabel("Silhouette Score") plt.show() print(f"best n_components = {best_n_components}") print(f"best Silhouette Score = {best_silhouette_score}") # 使用最佳的n_components进行聚类 best_nmf = NMF(n_components=best_n_components) best_features = best_nmf.fit_transform(X_scaled) # labels = best_nmf.components_.argmax(axis=1) labels = best_nmf.transform(X_scaled).argmax(axis=1) # 使用PCA进行降维和可视化 pca = PCA(n_components=2) X_pca = pca.fit_transform(X_scaled) # 可视化聚类结果 plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], c=labels) plt.title(f"NMF Clustering (n_components={best_n_components}) with PCA Visualization") plt.xlabel("Principal Component 1") plt.ylabel("Principal Component 2") plt.show()中文解析代码流程和步骤

对于每个n_components，使用fit_transform函数计算特征矩阵features和标签矩阵labels。使用calinski_harabasz_score函数计算聚类结果的轮廓系数，并将结果存储在silhouette_scores列表中。 4. 选择最佳的n_...

pca = PCA(n_components=2) X_pca = pca.fit_transform(pred_images)如果用散点图来对这降维后的二维数组进行可视化，横坐标和纵坐标代表PCA降维后的样本数量和降维后的特征数吗

在代码pca = PCA(n=2)和X_pca = pca_transform(pred_images)中，n_components=2表示我们希望将数据降低到维。而X_pca是经过PCA降维后的二维数组，其中每个样本具有2个特征。 因此，如果用散点图来对降维后的...

from sklearn.decomposition import PCA def pca_demo(data): transfer = PCA(n_components=0.92) data_new = transfer.fit_transform(data) print(data_new) return data_new if __name__ == '__main__': X_new = pca_demo(X_new)注释

在函数内部，首先创建了一个PCA对象transfer，其中n_components参数被设置为0.92，表示希望将数据降维到保留92%的方差。接着，调用fit_transform方法将数据集进行降维处理，并将结果保存在data_new中。最后...

pca = PCA(n_components=2) X_pca = pca.fit_transform(pred_images)，这其中二维数据分别都代表啥，如果用散点图来对这降维后的二维数组进行可视化，横坐标和纵坐标分别代表啥

在中，经过PCA降维后，X_pca表示降维后的二维数组。让我来解释一下这两个维度代表的含义： - 横坐标（X轴）代表第一个主分（PC1），它原始数据在降后的方向上的投影。PC1是在保留最大方差的条件下确定的第一个...

pca = PCA(n_components=5) pca.fit(Data) Std_pca=pca.transform(Data)

The first line creates an instance of the PCA (Principal Component Analysis) class with an argument of n_components=5, which specifies that we want to reduce the dimensionality of the data to 5 ...

import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.decomposition import PCA # 进行PCA降维 pca = PCA(n_components=2) x_pca = pca.fit_transform(x) # 绘制散点图 fig, (ax1, ax2) = plt.subplots(1, 2, figsize=(10, 5)) ax1.scatter(x_pca[:, 0], x_pca[:, 1], c=y) ax1.set_title('Original dataset') # 进行ADASYN过采样 adasyn = ADASYN(random_state=42) x_resampled, y_resampled = adasyn.fit_resample(x, y) # 进行PCA降维 x_resampled_pca = pca.transform(x_resampled) # 绘制散点图 ax2.scatter(x_resampled_pca[:, 0], x_resampled_pca[:, 1], c=y_resampled) ax2.set_title('Resampled dataset') plt.show()把点弄小一点

pca = PCA(n_components=2) x_pca = pca.fit_transform(x) # 绘制散点图 fig, (ax1, ax2) = plt.subplots(1, 2, figsize=(10, 5)) ax1.scatter(x_pca[:, 0], x_pca[:, 1], c=y, s=10) ax1.set_title('Original ...

from sklearn.decomposition import PCA # 提取表二中的特征 X = movie_data[['movie_id']] # 确定特征维度 n_features = X.shape[1] # 设置n_components的值，不超过特征维度的范围 n_components = min(n_features, 2) # 使用主成分分析（PCA）进行特征提取 pca = PCA(n_components=n_components) X_new = pca.fit_transform(X) # 创建新的特征列 for i in range(n_components): movie_data[f'PCA{i+1}'] = X_new[:, i] # 打印提取的特征 print(movie_data[['movie_id'] + [f'PCA{i+1}' for i in range(n_components)]])

- 使用PCA进行特征提取：初始化PCA类，传入n_components参数，然后使用fit_transform()函数拟合数据并将其转换为新的特征矩阵X_new； - 创建新的特征列：使用for循环遍历主成分数，依次将X_new中的每一列数据存储到...

from sklearn.metrics import RocCurveDisplay from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.metrics import confusion_matrix,accuracy_score from sklearn.preprocessing import StandardScaler from sklearn.linear_model import LogisticRegression from sklearn import tree from sklearn.decomposition import PCA import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier data = pd.read_csv("C:\\Users\\sa'y\\Desktop\\framinghamData(1).csv") X = data[["sysBP", "diaBP", "age", "totChol", "BMI", "heartRate", "glucose"]] y = data[['TenYearCHD']] new_data = pd.concat([X, y], axis=1) print(new_data.head()) scaler = StandardScaler() X_scaled = scaler.fit_transform(X) print(X_scaled) corr = new_data.corr(method='pearson') sns.heatmap(corr, annot=True, cmap='coolwarm') plt.show() pca = PCA(n_components=7) newX = pca.fit_transform(X) x_data = ['PC1','PC2','PC3','PC4','PC5','PC6','PC7'] y_data = np.around(pca.explained_variance_ratio_, 2) plt.bar(x=x_data, height=y_data,color='steelblue', alpha=0.8) plt.show() 在上述代码基础上，请给出下一步的代码，要求是： 计算所有主成分之间的皮尔逊相关系数，并用热图Heatmap的形式展示出来

import numpy as np ...sns.heatmap(corr_pca, cbar=True, annot=True, square=True, fmt='.2f', annot_kws={'size': 10}, yticklabels=x_data, xticklabels=x_data) plt.savefig('corr_pca_heatmap.png') plt.show()
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