import numpy as np from ase.io import read # 读取POSCAR或cif文件 atoms = read('POSCAR') # 获取C原子坐标 C_coords = atoms.get_positions()[atoms.get_chemical_symbols() == 'C'] # 计算x坐标相同的原子个数 x_counts = np.unique(C_coords[:, 0], axis=0, return_counts=True)[1] # 计算y坐标相同的原子个数 y_counts = np.unique(C_coords[:, 1], axis=0, return_counts=True)[1] # 计算z坐标相同的原子个数 z_counts = np.unique(C_coords[:, 2], axis=0, return_counts=True)[1] print('x坐标相同的原子个数:', x_counts) print('y坐标相同的原子个数:', y_counts) print('z坐标相同的原子个数:', z_counts)。帮我添加调试代码来检查程序的正确性,比如在计算C原子坐标前先输出一下atoms对象来检查是否成功读取了POSCAR文件。或者在计算完C_coords后,输出一下C_coords的形状和内容,看看是否正确获取了符合条件的C原子坐标
时间: 2024-03-03 14:51:00 浏览: 83
import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import math
好的,你可以添加以下调试代码来检查程序的正确性:
```
import numpy as np
from ase.io import read
# 读取POSCAR或cif文件
atoms = read('POSCAR')
# 检查是否成功读取POSCAR文件
print(atoms)
# 获取C原子坐标
C_coords = atoms.get_positions()[atoms.get_chemical_symbols() == 'C']
# 检查是否正确获取符合条件的C原子坐标
print(C_coords.shape)
print(C_coords)
# 计算x坐标相同的原子个数
x_counts = np.unique(C_coords[:, 0], axis=0, return_counts=True)[1]
# 计算y坐标相同的原子个数
y_counts = np.unique(C_coords[:, 1], axis=0, return_counts=True)[1]
# 计算z坐标相同的原子个数
z_counts = np.unique(C_coords[:, 2], axis=0, return_counts=True)[1]
print('x坐标相同的原子个数:', x_counts)
print('y坐标相同的原子个数:', y_counts)
print('z坐标相同的原子个数:', z_counts)
```
这样你就可以在控制台中看到atoms对象的内容,以及获取的C原子坐标的形状和内容,方便你判断程序是否正确获取了符合条件的C原子坐标。
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