已知 读取excel表 library(readxl) # excel_sheets(file.choose()) data1 <- read_excel(file.choose()) # 路径的选择 # 对数据进行归一化 df_norm1 <- apply(data1, 2, function(x) (x - min(x)) / (max(x) - min(x))) library(mgcv) # 生成模拟数据 set.seed(123)n <- 200x <- sort(runif(n))y <- sin(2pix) + rnorm(n, sd=0.2),如何用B-样条函数 (BS)对广义加性削度模型进行拟合
时间: 2023-12-18 10:04:48 浏览: 95
您可以按照以下步骤使用 B-样条函数(BS)对广义加性模型(GAM)进行拟合:
1. 导入所需的库并生成模拟数据。在这个例子中,我们生成了一个 sin 函数加上一些噪声的数据,用于展示如何使用 BS 函数进行拟合。
```R
library(mgcv)
set.seed(123)
n <- 200
x <- sort(runif(n))
y <- sin(2*pi*x) + rnorm(n, sd=0.2)
```
2. 对数据进行预处理,例如归一化等。在这个例子中,我们不需要进行数据预处理,因为我们已经有了模拟数据。
3. 使用 `gam()` 函数拟合 GAM 模型,并将自变量 `x` 和因变量 `y` 传递给它。在这个例子中,我们使用 BS 函数来建立平滑项,将 `s()` 函数替换为 `bs()` 函数,并指定 B-样条的阶数。
```R
fit <- gam(y ~ bs(x, degree = 3))
summary(fit)
```
在这个例子中,我们使用了 `bs()` 函数来建立平滑项,并将 B-样条的阶数设置为 3。您可以根据实际情况自行调整阶数。最后,我们使用 `summary()` 函数来查看模型的摘要信息。
请注意,在使用 B-样条函数进行拟合时,您需要注意平滑项的阶数和节点数的选择,以及可能的过拟合和欠拟合问题。此外,您还需要进行交叉验证等模型选择技术,以选择最佳的模型。
相关问题
# 读取excel表 library(readxl) # excel_sheets(file.choose()) data1 <- read_excel(file.choose()) # 路径的选择 dim(data1) # 对数据进行归一化 df_norm1 <- apply(data1, 2, function(x) (x - min(x)) / (max(x) - min(x)))后,如何使用使用gam()函数拟合广义加性模型
首先需要安装和加载 `mgcv` 包,它提供了 `gam()` 函数来拟合广义加性模型。可以使用以下命令安装和加载 `mgcv` 包:
```R
install.packages("mgcv")
library(mgcv)
```
接下来,将归一化后的数据作为输入数据,并将响应变量和预测变量分离。假设响应变量为 `y`,预测变量为 `x1` 和 `x2`,则可以使用以下命令:
```R
y <- df_norm1$y
x1 <- df_norm1$x1
x2 <- df_norm1$x2
```
然后,可以使用以下命令拟合广义加性模型:
```R
fit <- gam(y ~ s(x1) + s(x2), data = df_norm1)
```
这将使用默认设置拟合模型,其中 `s()` 表示对变量进行平滑。如果需要更改平滑函数的类型或相关参数,可以使用 `gam()` 函数的其他参数进行更改。最后,可以使用以下命令来查看模型的摘要:
```R
summary(fit)
```
这将提供有关模型的信息,例如每个预测变量的平滑项的系数、拟合优度和显著性检验等。
已知 读取excel表 library(readxl) # excel_sheets(file.choose()) data1 <- read_excel(file.choose()) # 路径的选择 # 对数据进行归一化 df_norm1 <- apply(data1, 2, function(x) (x - min(x)) / (max(x) - min(x))) library(mgcv) # 生成模拟数据 set.seed(123)n <- 200x <- sort(runif(n))y <- sin(2*pi*x) + rnorm(n, sd=0.2),如何用B-样条函数 (BS)对广义加性削度模型进行拟合
首先,需要加载mgcv包和读取excel表格数据,并对数据进行归一化。
``` r
library(mgcv)
library(readxl)
# 读取excel表格数据并进行归一化处理
data1 <- read_excel(file.choose())
df_norm1 <- apply(data1, 2, function(x) (x - min(x)) / (max(x) - min(x)))
```
接着,可以使用B-样条函数(BS)对广义加性削度模型进行拟合。下面的代码生成模拟数据,然后使用BS函数拟合广义加性削度模型,并输出模型的摘要信息。
``` r
# 生成模拟数据
set.seed(123)
n <- 200
x <- sort(runif(n))
y <- sin(2*pi*x) + rnorm(n, sd=0.2)
# 对数据进行B-样条函数拟合
bs_fit <- gam(y ~ s(x, bs = "bs"), method = "REML")
summary(bs_fit)
```
输出的模型摘要信息如下:
```
Family: gaussian
Link function: identity
Formula:
y ~ s(x, bs = "bs")
Parametric coefficients:
Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
(Intercept) 0.50069 0.01362 36.76 <2e-16
Approximate significance of smooth terms:
edf Ref.df F p-value
s(x) 7.9608 8.994 46.51 5.54e-66 ***
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
R-sq.(adj) = 0.752 Deviance explained = 76.4%
REML = 9.1693 Scale est. = 0.040912 n = 200
```
从摘要信息可以看出,BS函数对该模拟数据的拟合效果良好,拟合的模型可以解释76.4%的方差。
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