R语言对于分类变量用支持向量机进行预测并对训练集和测试集预测及绘制AUC曲线的示例
时间: 2025-01-01 08:38:05 浏览: 7
R语言中,我们可以使用`e1071`包中的`svm()`函数来进行支持向量机(SVM)模型的构建,然后通过`prediction()`和`performance()`函数对训练集和测试集进行预测,并利用`pROC`包来绘制AUC(Area Under Curve)曲线。下面是一个简单的示例:
首先,假设我们已经有了一个数据框`data`,其中包含分类变量`response`和其它特征变量。
```r
library(e1071)
library(pROC)
# 加载数据
data <- read.csv("your_data.csv") # 替换为你的数据文件
# 定义响应变量和特征变量
response <- data$response
features <- data[, -which(names(data) == "response")]
# 划分训练集和测试集
set.seed(123) # 设置随机种子保证结果可复现
trainIndex <- sample(1:nrow(features), 0.8 * nrow(features))
trainData <- features[trainIndex, ]
testData <- features[-trainIndex, ]
trainResponse <- response[trainIndex]
testResponse <- response[-trainIndex]
# 使用支持向量机模型
model <- svm(response ~ ., data = trainData, type = "c-classification")
# 预测
trainPreds <- predict(model, trainData)
testPreds <- predict(model, testData)
# 计算性能指标
perf_train <- performance(prediction(trainResponse, trainPreds), measure = "tpr", x.measure = "fpr")
perf_test <- performance(prediction(testResponse, testPreds), measure = "tpr", x.measure = "fpr")
# 绘制AUC曲线
plot(perf_train, main = "Training Set AUC Curve", col = "blue")
lines(perf_test, col = "red")
legend("topright", legend = c("Training", "Testing"), lty = 1, col = c("blue", "red"))
title("Receiver Operating Characteristic (ROC) Curve for SVM Classification")
```
在这个例子中,`type = "c-classification"`表示二分类问题。运行上述代码后,你会看到训练集和测试集的AUC曲线。注意,你需要根据实际情况替换数据文件名、列名等。
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