linux安装gromacs
时间: 2023-11-05 10:50:44 浏览: 114
要在Linux系统上安装GROMACS,可以按照以下步骤:
1. 打开终端,并使用以下命令安装GROMACS的依赖项:
```
sudo apt-get update
sudo apt-get install build-essential cmake zlib1g-dev libbz2-dev libboost-all-dev libopenblas-dev liblapack-dev mpich libxml2-dev
```
2. 下载GROMACS的tarball文件,可以从官网(http://www.gromacs.org/Downloads)下载最新版本。
3. 解压tarball文件,进入解压后的目录。
4. 使用以下命令创建一个新的构建目录:
```
mkdir build
cd build
```
5. 运行以下命令生成Makefile:
```
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON
```
这将使用GROMACS自己的FFT库构建GROMACS。
如果系统上已经安装了FFTW库,则可以使用以下命令:
```
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=OFF
```
6. 运行以下命令编译GROMACS:
```
make
```
7. 安装GROMACS:
```
sudo make install
```
安装完成后,您可以使用以下命令验证GROMACS是否正确安装:
```
gmx --version
```
如果一切正常,它应该输出GROMACS的版本信息。
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