计算不同分类特征指标对9种土壤类型的J-M距离值python代码
时间: 2024-03-21 20:39:36 浏览: 22
这里提供一份示例代码,希望能帮到你:
```python
import pandas as pd
from scipy.spatial.distance import pdist
from scipy.spatial.distance import squareform
# 读取数据
data = pd.read_csv('soil_data.csv')
# 提取分类特征和J-M距离值所需的数据
features = data.iloc[:, 1:11] # 假设分类特征在第1到第10列
distances = data.iloc[:, 11:] # 假设J-M距离值在第11列及以后
# 计算不同分类特征指标对J-M距离值的距离
dist_matrix = pdist(distances, metric='jaccard') # 使用Jaccard距离
dist_matrix = squareform(dist_matrix)
for i in range(features.shape[1]):
for j in range(i+1, features.shape[1]):
feature_pair = [features.iloc[:, i], features.iloc[:, j]]
feature_pair = pd.concat(feature_pair, axis=1)
feature_pair = feature_pair.dropna()
feature_dist_matrix = pdist(feature_pair, metric='jaccard')
feature_dist_matrix = squareform(feature_dist_matrix)
print(f"分类特征{i+1}和{j+1}的J-M距离值:")
print(feature_dist_matrix)
```
这份代码假设数据文件`soil_data.csv`中第1到第10列是分类特征,第11列及以后是J-M距离值。
代码中使用的是Jaccard距离,你也可以根据需要选择其他距离度量方法。最后输出的是每对分类特征指标对应的J-M距离值,共有45对(C(10,2))不同的组合。