python最优传输理论的搜索变换矩阵,示例
时间: 2023-08-18 11:40:55 浏览: 47
以下是一个使用OT库在Python中计算搜索变换矩阵的示例代码:
```python
import numpy as np
from scipy.spatial.distance import cdist
from ot import emd
# 两个分布
p = np.array([0.2, 0.3, 0.5])
q = np.array([0.1, 0.6, 0.3])
# 距离矩阵
C = cdist(np.array([1, 2, 3]).reshape(-1, 1), np.array([1, 2, 3]).reshape(-1, 1))
# 计算搜索变换矩阵
T = emd(p, q, C)
print(T)
```
在上面的示例中,我们首先定义了两个分布p和q,它们分别表示两个离散概率分布。然后,我们使用cdist函数计算了距离矩阵C,其中每个元素表示从第一个分布中的一个元素移动到第二个分布中的一个元素的成本。最后,我们使用emd函数计算最小的移动成本,并返回一个M×N的矩阵T,其中每个元素表示从一个分布中的一个元素移动到另一个分布中的一个元素的成本。这个矩阵就是搜索变换矩阵。
相关问题
python最优传输理论的搜索变换矩阵
Python中的最优传输理论通常使用OT(Optimal Transport)库来实现。搜索变换矩阵可以使用该库中的EMD(Earth Mover's Distance)函数来计算。EMD函数的输入是两个分布以及它们之间的距离矩阵。距离矩阵可以是M×N的矩阵,其中M和N分别为两个分布中元素的个数。在OT库中,可以使用dist函数来计算两个分布之间的距离矩阵。然后,可以使用emd函数来计算最小的移动成本,并返回一个M×N的矩阵,其中每个元素表示从一个分布中的一个元素移动到另一个分布中的一个元素的成本。这个矩阵就是搜索变换矩阵。
python最优传输理论的搜索变换矩阵,示例(要求用pot)
使用 `pot` 模块计算最优传输问题的搜索变换矩阵相对来说比较简单。下面是一个使用 `pot` 模块计算搜索变换矩阵的示例代码:
```python
import numpy as np
import ot
# 生成两个概率分布
p = np.random.rand(100)
p /= p.sum()
q = np.random.rand(100)
q /= q.sum()
# 计算距离矩阵
n = len(p)
m = len(q)
C = np.zeros((n, m))
for i in range(n):
for j in range(m):
C[i,j] = abs(i-j)
# 计算搜索变换矩阵
T = ot.emd(p, q, C)
```
在这个示例中,我们先生成两个随机的概率分布 `p` 和 `q`,并计算它们之间的距离矩阵 `C`。然后,我们使用 `ot.emd()` 函数计算搜索变换矩阵,其中 `emd` 代表 Earth Mover's Distance,是最优传输问题的一种形式。
`ot.emd()` 函数的参数包括两个概率分布 `p` 和 `q`,以及距离矩阵 `C`。函数的返回值是搜索变换矩阵 `T`。
需要注意的是,使用 `pot` 模块计算搜索变换矩阵时,需要先安装 `pot` 模块。您可以使用以下命令进行安装:
```
pip install pot
```
或者在 Anaconda 环境中使用以下命令进行安装:
```
conda install -c conda-forge pot
```
`pot` 模块除了可以计算搜索变换矩阵之外,还提供了其他一些有用的函数和类,用于解决最优传输问题和相关的问题。