经prot = apply(prot,1,function(x) log2(x/median(x,na.rm = T))),第二次使用转置了行列怎么解决
时间: 2023-08-17 16:05:02 浏览: 47
如果你在第一次使用 apply() 函数时,对行进行了操作并转置了矩阵,那么在第二次使用 apply() 函数时,你需要对列进行操作并不进行转置。
例如,你可以这样写代码:
```
prot <- t(apply(prot, 1, function(x) log2(x/median(x, na.rm = TRUE))))
prot <- apply(prot, 2, function(x) log2(x/median(x, na.rm = TRUE)))
```
这里我们先对行进行操作并转置了矩阵,然后对列进行操作而不进行转置。这样就可以避免转置导致的问题了。
相关问题
经prot = apply(prot,1,function(x) log2(x/median(x,na.rm = T))),行列改变了为什么
这是因为`apply()`函数对矩阵或数组进行操作时,默认是按行进行操作的。也就是说,`apply(prot, 1, function(x) log2(x/median(x,na.rm = T)))`这行代码是把`prot`矩阵的每一行取出来,然后分别计算每行元素除以该行中位数的对数值,最后再把新的结果拼接成一个新的矩阵。
因此,通过`apply()`函数进行计算后,矩阵的行列关系发生了改变,行数与原矩阵相同,但列数可能已经改变了。如果你想保持原来的行列状态,可以使用`apply()`函数的第二个参数来指定操作的维度,例如`apply(prot, 2, function(x) log2(x/median(x,na.rm = T)))`表示按列进行操作,不改变矩阵的行列状态。
prot = apply(prot,1,function(x) log2(x/median(x,na.rm = T)))
这行代码的作用是将一个矩阵或数据框的每一行进行计算,计算方法是将每个元素除以该行的中位数,然后取对数(以2为底),最后返回一个新的矩阵或数据框。这个操作可以用来对数据进行归一化处理,使得不同行之间的值具有可比性。其中,apply函数是R语言中的一个函数,它可以将一个函数应用到矩阵或数据框的每一个维度上,这里的1表示按行操作,na.rm参数表示忽略缺失值。