Error in ggplot(prot_len_comp, aes(x = Length, y = Composition["L"])) : object 'prot_len_comp' not found

这个错误提示说明在你运行 ggplot 函数之前，R找不到名为 prot_len_comp 的数据框。这可能是因为你没有正确加载或创建数据框，或者在运行 ggplot 函数之前没有将数据框传递给它。

确保你已经创建了名为 prot_len_comp 的数据框，并且已经正确加载了它。如果你已经加载了数据框，那么请检查是否有拼写错误或者大小写错误。如果你已经创建了数据框，但是没有将它传递给 ggplot 函数，那么你需要在 ggplot 函数中使用该数据框，例如：

ggplot(data = prot_len_comp, aes(x = Length, y = Composition["L"])) + ...

在这个例子中，我们将 prot_len_comp 数据框传递给 ggplot 函数，并使用 aes 函数设置 x 和 y 的变量。