帮我写python代码,使用皮尔逊相关系数作为距离测量进行 KMeans 聚类的 Python 代码,质心的计算使用 minimize 方法,使得质心皮尔逊系数最近,然后再用minimize方法将其放大使其欧式距离也最近。
时间: 2024-03-10 12:44:46 浏览: 90
好的,以下是使用皮尔逊相关系数作为距离测量进行 KMeans 聚类的 Python 代码,质心的计算使用 minimize 方法的示例代码:
```python
import numpy as np
from scipy.spatial.distance import pdist, squareform
from scipy.optimize import minimize
def pearson_similarity(x, y):
# 计算皮尔逊相关系数
return np.corrcoef(x, y)[0, 1]
def kmeans_pearson(data, k):
# 计算数据点之间的皮尔逊相关系数
dists = squareform(pdist(data, metric=pearson_similarity))
# 随机选择 k 个点作为初始质心
centroids_idx = np.random.choice(np.arange(len(data)), k, replace=False)
centroids = data[centroids_idx]
# 迭代聚类过程
while True:
# 计算每个点到质心的距离
labels = np.argmin(dists[:, centroids_idx], axis=1)
# 更新质心位置
for i in range(k):
idx = np.where(labels == i)[0]
if len(idx) == 0:
continue
centroids[i] = minimize(lambda x: np.sum(dists[np.ix_(idx, idx)].reshape(-1) * x),
[1.0] * len(idx),
method='SLSQP',
bounds=[(0.0, None)] * len(idx),
constraints=[{'type': 'eq', 'fun': lambda x: np.sum(x) - 1.0}]).x
# 如果质心没有变化,则停止迭代
if np.allclose(centroids, data[centroids_idx]):
break
centroids_idx = np.argmin(squareform(pdist(centroids, metric=pearson_similarity)), axis=1)
# 用 minimize 方法将质心放大使其欧式距离也最近
for i in range(k):
centroids[i] = minimize(lambda x: np.sum((data - x) ** 2, axis=1),
centroids[i],
method='L-BFGS-B',
bounds=[(None, None)] * len(centroids[i])).x
return centroids, labels
```
其中 `data` 是输入数据,`k` 是聚类的个数。该函数返回质心和每个数据点对应的标签。
阅读全文
相关推荐
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241231045053.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241231044955.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241231045053.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20250102104920.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241231044930.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)