请你构造两层的GAT,对形状为(1358,7,12,307,2)的交通数据集训练预测。307是交通传感器节点个数,2是特征维度,包括速度特征和根据邻接矩阵划分的度特征。构造两层GAT作为VAE的编码器,用点注意力机制对度一致的节点计算注意力系数,这个pytorch代码怎么写?利用for循环对度一致的节点计算注意力系数,第一列是交通特征,第二列是节点的度特征。最好能告诉我每一行代码在做什么。在forward阶段希望不要出现nn.Sequential不能处理多输入特征的情况并避免避免内存过大、邻接矩阵分配过大、killed等情况,是pytorch版本。
时间: 2024-03-01 22:52:42 浏览: 130
好的,我会按照您的要求来解答这个问题。
首先,对于构造两层的GAT,我们需要先定义GAT层的类。代码如下:
```python
import torch
import torch.nn.functional as F
class GATLayer(torch.nn.Module):
def __init__(self, in_dim, out_dim, num_heads):
super(GATLayer, self).__init__()
self.in_dim = in_dim
self.out_dim = out_dim
self.num_heads = num_heads
self.fc = torch.nn.Linear(in_dim, out_dim*num_heads, bias=False)
self.attn_fc = torch.nn.Linear(2*out_dim, 1, bias=False)
def forward(self, x, adj):
x = self.fc(x).view(-1, self.num_heads, self.out_dim)
x = x.transpose(0, 1)
adj = adj.unsqueeze(0).repeat(self.num_heads, 1, 1)
h = torch.matmul(x, x.transpose(-2, -1)) / (self.out_dim ** 0.5)
attn = self.attn_fc(torch.cat([x, adj], dim=-1))
attn = attn.squeeze(-1).softmax(dim=-1)
h = torch.matmul(attn, h)
h = h.transpose(0, 1).reshape(-1, self.num_heads*self.out_dim)
return h
```
上述代码中,我们定义了GAT层的类`GATLayer`,包含了输入维度、输出维度和头数三个参数。在初始化函数中,我们定义了三个成员变量:输入维度、输出维度和头数,并且定义了两个全连接层`self.fc`和`self.attn_fc`。其中,`self.fc`是将输入的特征转换为多头输出的全连接层,`self.attn_fc`是用于计算注意力系数的全连接层,其中输入是拼接了节点特征和节点度特征的向量。
在`forward`函数中,我们首先将输入的特征通过全连接层`self.fc`转换为多头输出,并将头数作为第一维,将`adj`重复`num_heads`次,用于在多头计算注意力系数时计算多个头的注意力系数。接着,我们计算多个头的注意力系数`attn`,对于每个头,我们将节点特征和节点度特征拼接起来,通过`self.attn_fc`计算注意力系数。最后,我们将注意力系数与多头节点特征矩阵相乘,得到每个节点的表示`h`,将多头节点表示拼接起来,得到输出特征。
接下来,我们可以定义两层GAT的类,代码如下:
```python
class GAT(torch.nn.Module):
def __init__(self, in_dim, hidden_dim, out_dim, num_heads):
super(GAT, self).__init__()
self.gat1 = GATLayer(in_dim, hidden_dim, num_heads)
self.gat2 = GATLayer(num_heads*hidden_dim, out_dim, num_heads)
def forward(self, x, adj):
x = F.elu(self.gat1(x, adj))
x = self.gat2(x, adj)
return x
```
上述代码中,我们定义了两层GAT的类`GAT`,包含输入维度、隐藏层维度、输出维度和头数四个参数。在初始化函数中,我们定义了两个`GATLayer`实例,即两层GAT,其中第一层的输出维度是`num_heads*hidden_dim`,用于传递给第二层。在`forward`函数中,我们首先对输入特征进行第一层GAT计算,然后进行激活函数elu操作,最后进行第二层GAT计算,并返回输出特征。
接下来,我们可以使用上述代码来对形状为(1358,7,12,307,2)的交通数据集进行训练预测。代码如下:
```python
import torch.optim as optim
# define model
model = GAT(in_dim=2, hidden_dim=16, out_dim=8, num_heads=8)
# define optimizer
optimizer = optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01)
# define loss function
criterion = torch.nn.MSELoss()
# define input data
data = torch.randn(1358, 7, 12, 307, 2)
# define adjacency matrix
adj = torch.ones(307, 307)
# train model
for epoch in range(10):
optimizer.zero_grad()
output = model(data, adj)
loss = criterion(output, data)
loss.backward()
optimizer.step()
print('Epoch [{}/{}], Loss: {:.4f}'.format(epoch+1, 10, loss.item()))
```
上述代码中,我们首先定义了模型`model`、优化器`optimizer`和损失函数`criterion`。然后,我们定义了输入数据`data`,是一个形状为(1358,7,12,307,2)的张量,表示有1358个样本,每个样本包含7个时间步长,每个时间步长包含12个位置,每个位置有307个节点,每个节点有2个特征。接着,我们定义了邻接矩阵`adj`,是一个形状为(307,307)的张量,表示307个节点之间的连通关系。然后,我们进行10个epoch的训练,每个epoch中,我们先将梯度清零,然后计算模型的输出`output`,计算损失函数并进行反向传播和优化。最后,输出当前epoch的损失值。
最后,关于如何利用for循环对度一致的节点计算注意力系数,我们可以在`GATLayer`的`forward`函数中加入以下代码:
```python
# calculate degree
deg = torch.sum(adj, dim=-1)
deg = deg.unsqueeze(-1).repeat(1, 1, self.num_heads)
deg = deg.transpose(0, 1)
# calculate attention coefficients
for i in range(self.num_heads):
attn[:, i, :] = attn[:, i, :] / (deg ** 0.5)
```
上述代码中,我们首先通过邻接矩阵`adj`计算每个节点的度`deg`,然后将度重复`num_heads`次,用于在多头计算注意力系数时计算多个头的度。接着,我们在for循环中对每个头的注意力系数`attn`进行度一致性处理,即将注意力系数除以度的平方根。这样可以使得度比较大的节点对应的注意力系数更小,度比较小的节点对应的注意力系数更大,从而使得度比较大的节点对应的信息更加分散,度比较小的节点对应的信息更加聚焦。
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