帮我解释以下代码:from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram from matplotlib import pyplot as plt import numpy as np X = [[i] for i in [2, 8, 0, 4, 1, 9, 9, 0]] def plot_dendrogram(model, **kwargs): counts = np.zeros(model.children_.shape[0]) n_samples = len(model.labels_) for i, merge in enumerate(model.children_): current_count = 0 for child_idx in merge: if child_idx < n_samples: current_count += 1 else: current_count += counts[child_idx - n_samples] counts[i] = current_count linkage_matrix = np.column_stack( [model.children_, model.distances_, counts] ).astype(float) dendrogram(linkage_matrix, **kwargs) model = AgglomerativeClustering(n_clusters=None, distance_threshold=0, linkage='average') model.fit(X) plot_dendrogram(model) plt.show()
时间: 2024-03-15 18:42:45 浏览: 167
这段代码演示了如何使用层次聚类算法对数据进行聚类,并使用树状图展示聚类结果。
具体来说,代码中首先导入了需要用到的库,包括了sklearn的AgglomerativeClustering,scipy的dendrogram和matplotlib的pyplot。然后定义了一个列表X,其中包含了8个数字。接下来定义了一个函数plot_dendrogram,用于绘制树状图。在函数中,首先计算了每个聚类簇的样本数,然后构造了一个连接矩阵,将每个聚类簇的父子关系、距离以及样本数放在一起。最后调用dendrogram函数,传入连接矩阵和其他参数,即可绘制树状图。
接着,通过使用AgglomerativeClustering算法,将X数据集进行聚类。其中n_clusters=None表示不指定聚类的个数,distance_threshold=0表示聚类时不考虑距离阈值,linkage='average'表示使用平均链接法进行聚类。
最后,调用plot_dendrogram函数,传入已经训练好的聚类模型,即可绘制树状图展示聚类结果。最后调用plt.show()将图像显示出来。
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import numpy as np from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage import matplotlib.pyplot as plt # 生成一个距离矩阵 X = np.array([[0, 1], [0.4, 1], [0.7, 3], [1, 1], [1.5, 2]]) # 使用Ward方法进行层次聚类 Z = linkage(X, 'ward') # 绘制树状图 fig = plt.figure(figsize=(5, 3)) dn = dendrogram(Z) plt.show()这段代码中的ward方法是什么
在这段代码中,`ward` 是 `scipy.cluster.hierarchy.linkage` 函数的一个参数,它代表层次聚类算法的链接方法之一。Ward方法是一种凝聚式聚类算法,它的特点是将两个群集合并时,合并后的群集的平方误差和最小。在实际应用中,Ward方法常用于处理凸形的数据集,它能够较好地保持群集的凸性。
scipy.cluster.hierarchy.dendrogram函数实现鸢尾花数据集分裂聚类并可视化
好的,下面是一个使用`scipy.cluster.hierarchy.dendrogram`函数实现鸢尾花数据集分裂聚类并可视化的示例代码:
```python
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage
from sklearn.datasets import load_iris
# 载入鸢尾花数据集
iris = load_iris()
X = iris.data
y = iris.target
# 计算样本间的距离矩阵
Z = linkage(X, method='ward')
# 绘制聚类树
plt.figure(figsize=(10, 7))
plt.title('Hierarchical Clustering Dendrogram')
plt.xlabel('Sample Index')
plt.ylabel('Distance')
dendrogram(
Z,
leaf_rotation=90., # 旋转x轴标签
leaf_font_size=8., # x轴标签字体大小
)
plt.show()
```
上述代码首先使用`load_iris`函数载入鸢尾花数据集,并计算样本间的距离矩阵。然后,使用`dendrogram`函数绘制聚类树,并设置x轴标签旋转角度和字体大小。最后,使用`plt.show()`函数显示可视化结果。
注:上述代码使用了`method='ward'`来进行层次聚类,也可以使用其它距离度量和聚类方法进行分裂聚类。
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