用 dbSNP 数据库中 snp 染色体上位置更新 Hapmap 中 snp 的位置，首先从原始数据中提取 snp 的 rs 号和其在染色体上的位置，条件为组别标签 (22 列)为 GRCh37.p5（GRCh37.p5 根据所提供的数据版本进行判断，做相应 调整），染色体号(7 列)为 1-22，snp 在染色体上的位置(12 列)不为空。然后， 用提取出的位置替换 Hapmp 中的 snp 的物理位置。

可以通过以下步骤将 dbSNP 数据库中 SNP 的染色体位置更新到 HapMap 数据库中：

1. 从 dbSNP 数据库中下载所有符合条件的 SNP 数据。具体地，可以使用以下 SQL 查询语句：

   SELECT rs_id, chrom, chrom_start, chrom_end
   FROM snp
   WHERE batch_id = 'GRCh37.p5'
     AND chrom >= '1' AND chrom <= '22'
     AND chrom_start IS NOT NULL;

该查询语句将返回符合条件的 SNP 的 rs 号、染色体号和起始位置、终止位置等信息。

2. 从 HapMap 数据库中下载所有 SNP 的信息，包括 SNP 的 rs 号、染色体号和物理位置等。

3. 对于每个 HapMap SNP，找到 dbSNP 中具有相同 rs 号的 SNP，如果找到则用 dbSNP 中的物理位置替换 HapMap 中的物理位置。

4. 更新 HapMap 数据库中 SNP 的位置信息后，可以使用其他工具和技术来更新基因型数据和其他相关信息。

需要注意的是，由于 dbSNP 和 HapMap 数据库中使用的基因组版本可能不同，因此需要对位置信息进行转换和调整。另外，如果 dbSNP 中不存在某个 HapMap SNP 的信息，或者无法确定它们是否代表同一个 SNP，则需要进行进一步的分析和处理。