换个代码绘制代码R自带的数据集iris 列出了3个物种(specie) 的萼片长(sepal.lngth)、曹片宽(spal. width)、花瓣长(ptal.length).花瓣宽(petalwidth) 4个变量的各50个样本数据热图
时间: 2023-10-04 19:12:19 浏览: 50
好的,这里是使用R语言绘制iris数据集热图的代码:
```R
# 导入iris数据集
data(iris)
# 提取需要的数据
iris_data <- iris[, 1:4]
# 计算相关系数矩阵
corr_matrix <- cor(iris_data)
# 绘制热图
library(ggplot2)
ggplot(data = melt(corr_matrix), aes(x = Var2, y = Var1, fill = value)) +
geom_tile() +
scale_fill_gradient2(low = "blue", high = "red", mid = "white",
midpoint = 0, limit = c(-1,1), space = "Lab",
name="Pearson\nCorrelation") +
theme_minimal() +
theme(axis.text.x = element_text(angle = 45, vjust = 1,
size = 10, hjust = 1)) +
coord_fixed()
```
运行以上代码,即可绘制出iris数据集的热图,以展示各个变量之间的相关性。
相关问题
换个代码绘制代码R自带的数据集iris 列出了3个物种(specie) 的萼片长(sepal.lngth)、曹片宽(spal. width)、花瓣长(ptal.length).花瓣宽(petalwidth) 4个变量的各50个样本数据聚类图
好的,你可以使用下面的代码来绘制iris数据集的聚类图:
```R
# 加载必要的包
library(ggplot2)
library(dplyr)
library(cluster)
# 加载iris数据集
data(iris)
# 选择特定的变量和物种
iris_subset <- iris %>%
filter(Species %in% c("setosa", "versicolor", "virginica")) %>%
select(Species, Sepal.Length, Sepal.Width, Petal.Length, Petal.Width)
# 对数据进行聚类
iris_cluster <- iris_subset %>%
select(-Species) %>%
scale() %>%
dist() %>%
hclust()
# 绘制聚类图
ggplot(iris_subset, aes(x = Species, y = Petal.Length, color = as.factor(iris_cluster$clusters))) +
geom_point(size = 3) +
scale_color_manual(values = c("red", "blue", "green")) +
labs(title = "Iris Clustering", x = "Species", y = "Petal Length") +
theme_minimal()
```
这个代码首先加载了必要的包,然后从iris数据集中选择了特定的变量和物种。接下来,对数据进行了聚类,然后绘制了聚类图。聚类图上的颜色表示聚类结果,可以使用 `scale_color_manual` 函数来自定义颜色。最后,添加标题、轴标签和主题等,使图表更加美观易懂。
请给出能完成以下题目的R语言代码R自带的数据集iris 列出了3个物种(specie) 的萼片长(sepal.lngth)、曹片宽(spal. width)、花瓣长(ptal.length).花瓣宽(petalwidth) 4个变量的各50个样本数据、根据该数据集绘制以下图形. (1)绘制按species分组的轮廓图和雷达图. (2)绘制星图和脸谱图. (3)绘制聚类图和热图。
下面是能够完成以上要求的R语言代码:
```R
# 导入数据集iris
data(iris)
# (1) 按species分组的轮廓图和雷达图
library(ggplot2)
library(dplyr)
library(tidyr)
library(plotly)
# 轮廓图
ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width, color = Species)) +
geom_density_2d() +
labs(x = "Sepal Length", y = "Sepal Width") +
ggtitle("Contour plot by species")
# 雷达图
iris %>%
pivot_longer(cols = -Species) %>%
ggplot(aes(x = name, y = value, group = Species, color = Species)) +
geom_point() +
geom_line() +
labs(title = "Radar plot by species") +
facet_wrap(~Species, ncol = 1) +
theme(legend.position = "top")
# (2) 星图和脸谱图
library(fmsb)
library(RColorBrewer)
# 星图
iris_scaled <- as.data.frame(scale(iris[, 1:4]))
iris_scaled$Species <- iris$Species
iris_scaled_melt <- melt(iris_scaled, id.vars = "Species")
iris_scaled_melt %>%
ggplot(aes(x = variable, y = value, group = Species, color = Species)) +
geom_point(size = 3) +
scale_color_brewer(palette = "Set1") +
scale_y_continuous(limits = c(-2, 3)) +
labs(title = "Star plot by species") +
coord_polar()
# 脸谱图
library(ggplot2)
ggplot(data = iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width, col = Species)) +
geom_point() +
labs(title = "Facet plot by species") +
facet_grid(Species ~ .)
# (3) 聚类图和热图
library(ggplot2)
library(reshape2)
library(RColorBrewer)
# 聚类图
iris_cluster <- kmeans(iris[, 1:4], centers = 3, nstart = 20)
iris_cluster$cluster <- as.factor(iris_cluster$cluster)
iris_melt <- melt(iris, id.vars = "Species")
ggplot(data = iris_melt, aes(x = Species, y = value, fill = iris_cluster$cluster)) +
geom_boxplot() +
labs(title = "Cluster plot by species") +
scale_fill_brewer(palette = "Set1")
# 热图
library(gplots)
heatmap.2(as.matrix(iris[, 1:4]),
col = colorRampPalette(c("white", "blue"))(100),
trace = "none",
density.info = "none",
margins = c(10, 10),
dendrogram = "none")
```
希望这份代码能够帮助您完成绘制图形的任务。
相关推荐
![rar](https://img-home.csdnimg.cn/images/20210720083606.png)
![zip](https://img-home.csdnimg.cn/images/20210720083736.png)
![zip](https://img-home.csdnimg.cn/images/20210720083736.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![](https://csdnimg.cn/download_wenku/file_type_ask_c1.png)
![zip](https://img-home.csdnimg.cn/images/20210720083736.png)
![rar](https://img-home.csdnimg.cn/images/20210720083606.png)