换个代码绘制代码R自带的数据集iris 列出了3个物种(specie) 的萼片长(sepal.lngth)、曹片宽(spal. width)、花瓣长(ptal.length).花瓣宽(petalwidth) 4个变量的各50个样本数据热图

时间: 2023-10-04 19:12:19 浏览: 50
好的,这里是使用R语言绘制iris数据集热图的代码: ```R # 导入iris数据集 data(iris) # 提取需要的数据 iris_data <- iris[, 1:4] # 计算相关系数矩阵 corr_matrix <- cor(iris_data) # 绘制热图 library(ggplot2) ggplot(data = melt(corr_matrix), aes(x = Var2, y = Var1, fill = value)) + geom_tile() + scale_fill_gradient2(low = "blue", high = "red", mid = "white", midpoint = 0, limit = c(-1,1), space = "Lab", name="Pearson\nCorrelation") + theme_minimal() + theme(axis.text.x = element_text(angle = 45, vjust = 1, size = 10, hjust = 1)) + coord_fixed() ``` 运行以上代码,即可绘制出iris数据集的热图,以展示各个变量之间的相关性。
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换个代码绘制代码R自带的数据集iris 列出了3个物种(specie) 的萼片长(sepal.lngth)、曹片宽(spal. width)、花瓣长(ptal.length).花瓣宽(petalwidth) 4个变量的各50个样本数据聚类图

好的,你可以使用下面的代码来绘制iris数据集的聚类图: ```R # 加载必要的包 library(ggplot2) library(dplyr) library(cluster) # 加载iris数据集 data(iris) # 选择特定的变量和物种 iris_subset <- iris %>% filter(Species %in% c("setosa", "versicolor", "virginica")) %>% select(Species, Sepal.Length, Sepal.Width, Petal.Length, Petal.Width) # 对数据进行聚类 iris_cluster <- iris_subset %>% select(-Species) %>% scale() %>% dist() %>% hclust() # 绘制聚类图 ggplot(iris_subset, aes(x = Species, y = Petal.Length, color = as.factor(iris_cluster$clusters))) + geom_point(size = 3) + scale_color_manual(values = c("red", "blue", "green")) + labs(title = "Iris Clustering", x = "Species", y = "Petal Length") + theme_minimal() ``` 这个代码首先加载了必要的包,然后从iris数据集中选择了特定的变量和物种。接下来,对数据进行了聚类,然后绘制了聚类图。聚类图上的颜色表示聚类结果,可以使用 `scale_color_manual` 函数来自定义颜色。最后,添加标题、轴标签和主题等,使图表更加美观易懂。

请给出能完成以下题目的R语言代码R自带的数据集iris 列出了3个物种(specie) 的萼片长(sepal.lngth)、曹片宽(spal. width)、花瓣长(ptal.length).花瓣宽(petalwidth) 4个变量的各50个样本数据、根据该数据集绘制以下图形. (1)绘制按species分组的轮廓图和雷达图. (2)绘制星图和脸谱图. (3)绘制聚类图和热图。

下面是能够完成以上要求的R语言代码: ```R # 导入数据集iris data(iris) # (1) 按species分组的轮廓图和雷达图 library(ggplot2) library(dplyr) library(tidyr) library(plotly) # 轮廓图 ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width, color = Species)) + geom_density_2d() + labs(x = "Sepal Length", y = "Sepal Width") + ggtitle("Contour plot by species") # 雷达图 iris %>% pivot_longer(cols = -Species) %>% ggplot(aes(x = name, y = value, group = Species, color = Species)) + geom_point() + geom_line() + labs(title = "Radar plot by species") + facet_wrap(~Species, ncol = 1) + theme(legend.position = "top") # (2) 星图和脸谱图 library(fmsb) library(RColorBrewer) # 星图 iris_scaled <- as.data.frame(scale(iris[, 1:4])) iris_scaled$Species <- iris$Species iris_scaled_melt <- melt(iris_scaled, id.vars = "Species") iris_scaled_melt %>% ggplot(aes(x = variable, y = value, group = Species, color = Species)) + geom_point(size = 3) + scale_color_brewer(palette = "Set1") + scale_y_continuous(limits = c(-2, 3)) + labs(title = "Star plot by species") + coord_polar() # 脸谱图 library(ggplot2) ggplot(data = iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width, col = Species)) + geom_point() + labs(title = "Facet plot by species") + facet_grid(Species ~ .) # (3) 聚类图和热图 library(ggplot2) library(reshape2) library(RColorBrewer) # 聚类图 iris_cluster <- kmeans(iris[, 1:4], centers = 3, nstart = 20) iris_cluster$cluster <- as.factor(iris_cluster$cluster) iris_melt <- melt(iris, id.vars = "Species") ggplot(data = iris_melt, aes(x = Species, y = value, fill = iris_cluster$cluster)) + geom_boxplot() + labs(title = "Cluster plot by species") + scale_fill_brewer(palette = "Set1") # 热图 library(gplots) heatmap.2(as.matrix(iris[, 1:4]), col = colorRampPalette(c("white", "blue"))(100), trace = "none", density.info = "none", margins = c(10, 10), dendrogram = "none") ``` 希望这份代码能够帮助您完成绘制图形的任务。

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