import os import PyPDF2 # PDF文件所在目录 pdf_folder = 'C:\Desktop\papers' # TXT文件所在目录 txt_folder = 'C:\Desktop\papers' # 遍历PDF文件夹中的所有PDF文件 for filename in os.listdir(pdf_papers): if filename.endswith('.pdf'): # 读取PDF文件 pdf_path = os.path.join(pdf_papers, filename) with open(pdf_path, 'rb') as f: pdf_reader = PyPDF2.PdfFileReader(f) # 遍历PDF文件中的所有页面 for page_num in range(pdf_reader.getNumPages()): # 将页面中的文本提取出来并写入TXT文件 page = pdf_reader.getPage(page_num) text = page.extractText() txt_filename = os.path.splitext(filename)[0] + '-page{}.txt'.format(page_num+1) txt_path = os.path.join(txt_folder, txt_filename) with open(txt_path, 'w', encoding='utf-8') as txt_file: txt_file.write(text)

时间: 2023-06-17 19:04:55 浏览: 137
这是一个Python脚本,用于将一个目录中的所有PDF文件中的文本提取出来,并将其写入到同目录下的TXT文件中。具体实现步骤如下: 1. 导入必要的模块:os模块和PyPDF2模块。 2. 定义PDF文件所在目录和TXT文件所在目录。 3. 遍历PDF文件夹中的所有PDF文件。 4. 对于每一个PDF文件,使用PyPDF2模块读取其内容。 5. 遍历PDF文件中的所有页面,将每一页中的文本提取出来。 6. 将提取出来的文本写入到同目录下的TXT文件中,文件名为原PDF文件名加上页码。
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import flowio import pandas as pd import os import csv # 设置输入和输出文件夹 input_folder = "D:/test_data_Fcs/" output_folder = "D:/test_data_Fcs/" # 遍历输入文件夹中的所有fcs文件 for filename in os.listdir(input_folder): if filename.endswith(".fcs"): # 从fcs文件中读取数据 fcs = flowio.FlowData(os.path.join(input_folder, filename)) events = fcs.events() # 将数据转换为pandas DataFrame df = pd.DataFrame(events) # 将DataFrame保存为csv文件 output_filename = os.path.join(output_folder, filename[:-4] + ".csv") df.to_csv(output_filename, index=False)出错:array.array' object is not callable

根据你提供的代码,我发现你没有在脚本开头导入 `numpy` 库,而 `flowio` 库的 `events()` 函数返回的是 `numpy.ndarray` 类型,需要使用 `numpy` 库的函数进行处理。因此,你需要在脚本开头导入 `numpy` 库,例如:`import numpy as np`。然后,你需要将 `events` 转换为 `pandas.DataFrame` 类型前,对它进行处理,代码如下: ```python import flowio import pandas as pd import numpy as np import os import csv # 设置输入和输出文件夹 input_folder = "D:/test_data_Fcs/" output_folder = "D:/test_data_Fcs/" # 遍历输入文件夹中的所有fcs文件 for filename in os.listdir(input_folder): if filename.endswith(".fcs"): # 从fcs文件中读取数据 fcs = flowio.FlowData(os.path.join(input_folder, filename)) # 处理events events = fcs.events() events = np.array(events.tolist()) # 将数据转换为pandas DataFrame df = pd.DataFrame(events) # 将DataFrame保存为csv文件 output_filename = os.path.join(output_folder, filename[:-4] + ".csv") df.to_csv(output_filename, index=False) ``` 这样就可以避免 `'array.array' object is not callable` 的问题了。

import os from datetime import datetime import random import string def batch_rename_files(folder_path, random_string_length=0): """ 批量重命名文件,名字改为该文件的创建或修改日期,如果有重名的文件,可以添加一个随机字符串 :param folder_path: 文件夹路径 :param random_string_length: 随机字符串长度,默认为0 """ for filename in os.listdir(folder_path): # 获取文件的创建时间或修改时间 full_path = os.path.join(folder_path, filename) if os.path.isfile(full_path): timestamp = os.path.getmtime(full_path) else: continue # 格式化时间 date_time = datetime.fromtimestamp(timestamp) new_name = date_time.strftime("%Y-%m-%d %H-%M-%S") # 添加随机字符串 if random_string_length > 0: random_string = ''.join(random.choices(string.ascii_lowercase + string.digits, k=random_string_length)) new_name += '-' + random_string # 拼接新的文件名 file_extension = os.path.splitext(filename)[1] new_filename = new_name + file_extension new_full_path = os.path.join(folder_path, new_filename) # 重命名文件 os.rename(full_path, new_full_path) if __name__ == '__main__': folder_path = 'your_folder_path' batch_rename_files(folder_path, random_string_length=5)

好的,根据你的要求,将以上代码修改为将修改后的文件命名恢复原来的命名,可以按照以下方式修改: ``` import os from datetime import datetime import random import string def restore_original_names(folder_path): """ 批量将文件名恢复为原来的名称,需要在修改文件名之前备份原来的名称 :param folder_path: 文件夹路径 """ for filename in os.listdir(folder_path): full_path = os.path.join(folder_path, filename) if os.path.isfile(full_path): # 获取备份的文件名 backup_filename = os.path.splitext(filename)[0] + ".bak" backup_full_path = os.path.join(folder_path, backup_filename) if os.path.exists(backup_full_path): # 将备份的文件名恢复为原来的文件名 os.rename(backup_full_path, full_path) def batch_rename_files(folder_path, random_string_length=0): """ 批量重命名文件,名字改为该文件的创建或修改日期,如果有重名的文件,可以添加一个随机字符串 :param folder_path: 文件夹路径 :param random_string_length: 随机字符串长度,默认为0 """ # 先将文件名备份 for filename in os.listdir(folder_path): full_path = os.path.join(folder_path, filename) if os.path.isfile(full_path): # 获取文件的后缀名 file_extension = os.path.splitext(filename)[1] # 备份原来的文件名 backup_filename = os.path.splitext(filename)[0] + ".bak" backup_full_path = os.path.join(folder_path, backup_filename) os.rename(full_path, backup_full_path) # 批量重命名文件 for filename in os.listdir(folder_path): full_path = os.path.join(folder_path, filename) if os.path.isfile(full_path): # 获取文件的创建时间或修改时间 timestamp = os.path.getmtime(full_path) # 格式化时间 date_time = datetime.fromtimestamp(timestamp) new_name = date_time.strftime("%Y-%m-%d %H-%M-%S") # 添加随机字符串 if random_string_length > 0: random_string = ''.join(random.choices(string.ascii_lowercase + string.digits, k=random_string_length)) new_name += '-' + random_string # 拼接新的文件名 new_filename = new_name + file_extension new_full_path = os.path.join(folder_path, new_filename) # 重命名文件 os.rename(full_path, new_full_path) # 将文件名恢复为原来的名称 restore_original_names(folder_path) if __name__ == '__main__': folder_path = 'your_folder_path' batch_rename_files(folder_path, random_string_length=5) ``` 这个修改后的代码首先会备份原来的文件名,然后批量重命名所有的文件,并最后将所有文件的名字恢复为原来的名称。
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这段代码在运行时import SimpleITK as sitkimport numpy as npimport os# 设置文件路径data_path = 'C:/Users/Administrator/Desktop/LiTS2017/'save_path = 'C:/Users/Administrator/Desktop/2D-LiTS2017/'if not os.path.exists(save_path): os.makedirs(save_path)# 定义函数将3D图像保存为2D的.png格式def save_image_as_png(image, save_folder, name_prefix): for i in range(image.shape[2]): slice = np.squeeze(image[:, :, i]) slice = slice.astype(np.float32) slice *= 255.0/slice.max() slice = slice.astype(np.uint8) save_name = os.path.join(save_folder, name_prefix + '_' + str(i) + '.png') sitk.WriteImage(sitk.GetImageFromArray(slice), save_name)# 读取Training Batch 1中的图像image_path = os.path.join(data_path, 'Training Batch 1/volume-0.nii')image = sitk.ReadImage(image_path)image_array = sitk.GetArrayFromImage(image)save_folder = os.path.join(save_path, 'image')if not os.path.exists(save_folder): os.makedirs(save_folder)save_image_as_png(image_array, save_folder, 'img')# 读取Training Batch 2中的标签label_path = os.path.join(data_path, 'Training Batch 2/segmentation-0.nii')label = sitk.ReadImage(label_path)label_array = sitk.GetArrayFromImage(label)# 将标签转换为灰度图并保存label_array[label_array == 1] = 128label_array[label_array == 2] = 255save_folder = os.path.join(save_path, 'mask')if not os.path.exists(save_folder): os.makedirs(save_folder)save_image_as_png(label_array, save_folder, 'mask')会出现RuntimeWarning: divide by zero encountered in true_divide slice *= 255.0/slice.max()这种情况,修复它,并给出完整代码

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