clf len = length(tout); xmax = 0; ymax = 0; zmax = 0; xmin = 0; ymin = 0; zmin = 0;
时间: 2024-02-05 20:04:53 浏览: 28
这是一段 MATLAB 代码,从变量名来看,它是在计算一组数据中的最大值和最小值。具体来说,它声明了一些变量(xmax、ymax、zmax、xmin、ymin、zmin),然后遍历了一个叫做tout的数组,计算出数组中的最大值和最小值,分别存储在对应的变量中。在这段代码中,clf len的含义不太清楚,可能是在清除之前的图形或者设置图形的长度。
相关问题
python使用random_state=0训练决策树分类器
在Python中使用random_state=0来训练决策树分类器,可以通过以下步骤实现:
1. 导入所需的库和数据集:
```python
import pandas as pd
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.metrics import accuracy_score
# 导入数据集
data = pd.read_csv('data.csv')
```
2. 准备数据集并将其划分为训练集和测试集:
```python
# 准备特征和目标变量
X = data.drop('target', axis=1)
y = data['target']
# 将数据集划分为训练集和测试集
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.2, random_state=0)
```
3. 创建并训练决策树分类器:
```python
# 创建决策树分类器对象
clf = DecisionTreeClassifier(random_state=0)
# 训练模型
clf.fit(X_train, y_train)
```
4. 使用训练好的模型进行预测:
```python
# 预测测试集
y_pred = clf.predict(X_test)
```
5. 评估模型的性能:
```python
# 计算模型的准确率
accuracy = accuracy_score(y_test, y_pred)
print('Accuracy:', accuracy)
```
在这个例子中,我们使用random_state=0来确保每次运行代码时都可以得到相同的训练和测试集。这样可以帮助我们在不同的实验中进行比较,并确保模型的可重复性。
我希望class=0的数据值都显示在y轴左侧
要将类0的数据值显示在y轴的左侧,你可以使用`shap.summary_plot`函数的`plot_type='bar'`参数,并设置`plot=False`来手动绘制摘要图。然后,你可以自定义绘图的方式,将类0的数据值放在y轴的左侧。下面是修改后的代码示例:
```python
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.model_selection import train_test_split
import shap
# 读取数据
data = pd.read_excel(r"D:桌面/CESHIJIANGWEI 1.xlsx", sheet_name="Ag2", index_col=0)
# 提取特征和目标变量
X = data.loc[1:440, ['shape', 'bacterial species', 'Detection method', 'concentration', 'size', 'response time']].astype(str).values
Y = data.loc[1:440, 'MIC performance rate'].values
# 划分训练集和测试集
train_x, test_x, train_y, test_y = train_test_split(X, Y, test_size=0.2, random_state=258)
# 设置决策树参数
parameters = {
'splitter': 'best',
'criterion': "gini",
"max_depth": 6,
'min_samples_leaf': 1,
"min_samples_split": 4,
}
feature_names = ['shape', 'bacterial species', 'Detection method', 'concentration', 'size', 'response time']
target_names = data['MIC performance rate'].unique().tolist()
# 模型训练
clf = DecisionTreeClassifier(**parameters)
clf.fit(train_x, train_y)
# SHAP解释器初始化
explainer = shap.TreeExplainer(clf)
# 计算SHAP值
shap_values = explainer.shap_values(test_x)
# 计算摘要统计值
expected_value = explainer.expected_value
feature_importances = np.abs(shap_values).mean(axis=0)
# 绘制摘要图
fig, ax = plt.subplots()
pos = np.arange(len(feature_names))
# 在y轴左侧绘制类0的数据值
ax.barh(pos, feature_importances, align='center', color='b')
ax.barh(pos, -feature_importances[test_y == 0], align='center', color='r')
# 设置y轴标签
ax.set_yticks(pos)
ax.set_yticklabels(feature_names)
# 设置x轴标签
ax.set_xlabel('Feature Importance')
# 设置标题
ax.set_title('SHAP Summary Plot')
# 显示图形
plt.tight_layout()
plt.savefig('shap_summary.pdf')
plt.show()
```
这样修改后,类0的数据值将显示在y轴的左侧。请记得适当调整图形的大小和布局,以便显示完整的图形和标签。