tcga肺胰癌表达数据下载R语言代码

以下是使用R语言下载TCGA肺癌和胰腺癌表达数据的示例代码：

# 安装和加载TCGAbiolinks包
install.packages("TCGAbiolinks")
library(TCGAbiolinks)

# 设置下载目录
setwd("your/path/to/download")

# 下载肺癌表达数据
query <- GDCquery(project = "TCGA-LUAD", 
                   data.category = "Transcriptome Profiling", 
                   data.type = "Gene Expression Quantification", 
                   workflow.type = "HTSeq - FPKM")
GDCdownload(query)

# 下载胰腺癌表达数据
query <- GDCquery(project = "TCGA-PAAD", 
                   data.category = "Transcriptome Profiling", 
                   data.type = "Gene Expression Quantification", 
                   workflow.type = "HTSeq - FPKM")
GDCdownload(query)

这里我们使用了`TCGAbiolinks`包，它提供了一个方便的接口来查询和下载TCGA数据。我们首先设置下载目录，然后使用`GDCquery`函数来指定数据类型和其他筛选条件，最后使用`GDCdownload`函数来下载数据。请注意，这个过程可能需要一些时间来完成，具体取决于您的网络速度和数据集的大小。