linux 将fasta文件分割四个约200M的序列
时间: 2024-01-07 13:05:48 浏览: 124
您好!针对您的问题,我可以为您提供以下的fasta文件分割方法:
假设您的fasta文件名为example.fasta,您可以使用以下命令将其分割为四个约200M的序列:
```bash
split -l $(grep -c "^>" example.fasta) example.fasta example_split_
```
上述命令将会将example.fasta文件按照每个文件包含的行数进行分割,每个文件包含的行数为fasta文件中的序列数,输出的文件名为example_split_aa、example_split_ab、example_split_ac、example_split_ad等。
接下来,您可以使用以下命令将每个分割出的文件按照约200M的大小再次分割:
```bash
split -b 200M example_split_aa example_split_aa_
split -b 200M example_split_ab example_split_ab_
split -b 200M example_split_ac example_split_ac_
split -b 200M example_split_ad example_split_ad_
```
上述命令将会将example_split_aa、example_split_ab、example_split_ac、example_split_ad等文件按照每个文件约200M的大小再次进行分割,输出的文件名为example_split_aa_aa、example_split_aa_ab、example_split_aa_ac等。
希望这些方法可以帮助到您!
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