用bpso对红外光谱数据进行波段筛选的代码

时间: 2023-08-22 17:07:10 浏览: 67
以下是使用 BPSO(Binary Particle Swarm Optimization)算法进行红外光谱数据波段筛选的示例代码: ```python import numpy as np import pandas as pd from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier from sklearn.metrics import accuracy_score from pyswarm import pso # 读取红外光谱数据 data = pd.read_csv('infrared_data.csv') # 将数据分为训练集和测试集 train_data, test_data, train_label, test_label = train_test_split( data.iloc[:,:-1], data.iloc[:,-1], test_size=0.3, random_state=42) # 定义适应度函数 def fitness_function(position, train_data, test_data, train_label, test_label): # 将位置向量转换为二进制矩阵,筛选出选择的波段 selected_bands = np.where(position == 1)[0] selected_train_data = train_data.iloc[:,selected_bands] selected_test_data = test_data.iloc[:,selected_bands] # 训练随机森林模型并预测测试集结果 rf = RandomForestClassifier(n_estimators=100, random_state=42) rf.fit(selected_train_data, train_label) pred_label = rf.predict(selected_test_data) # 返回精度作为适应度值 return -accuracy_score(test_label, pred_label) # 定义变量的上下限和粒子群大小 lb = np.zeros(data.shape[1]-1) ub = np.ones(data.shape[1]-1) n_particles = 20 # 使用 BPSO 算法进行波段筛选 best_position, best_fitness = pso(fitness_function, lb, ub, args=(train_data, test_data, train_label, test_label), swarmsize=n_particles, maxiter=50) # 输出最佳精度和选择的波段 print('Best Accuracy:', -best_fitness) selected_bands = np.where(best_position == 1)[0] print('Selected Bands:', selected_bands) ``` 代码中使用了 `pyswarm` 库实现了 BPSO 算法,适应度函数使用了随机森林分类器对波段进行筛选和分类。最终输出了最佳精度和选择的波段。注意,这里为了方便起见,使用了负的精度作为适应度值,因为 BPSO 算法是寻找最小值。

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