DBSCAN算法处理鸢尾花数据集,用轮廓系数作为判断依据,其中DBSCAN算法中eps和min_samples两个参数,如何取值使得,其对应的轮廓系数的值最高?针对上述问题给出详细的代码和注释
时间: 2023-12-03 07:45:28 浏览: 97
手工实现KNN和朴素贝叶斯算法对鸢尾花数据进行自动分类 完整代码+数据 可直接运行
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首先,我们需要导入需要的库,包括numpy、pandas、sklearn中的DBSCAN和metrics。代码如下:
```python
import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn.cluster import DBSCAN
from sklearn import metrics
```
然后,我们需要加载鸢尾花数据集。这里我们使用sklearn自带的iris数据集,代码如下:
```python
from sklearn.datasets import load_iris
iris = load_iris()
X = iris.data
y = iris.target
```
接下来,我们需要定义一个函数,用于计算每个参数组合对应的轮廓系数。代码如下:
```python
def get_silhouette_score(eps, min_samples):
dbscan = DBSCAN(eps=eps, min_samples=min_samples)
labels = dbscan.fit_predict(X)
if len(np.unique(labels)) == 1:
return -1
else:
return metrics.silhouette_score(X, labels)
```
在这个函数中,我们首先创建了一个DBSCAN对象,然后使用该对象对数据进行聚类,并计算轮廓系数。如果聚类结果只有一个簇,则返回-1,否则返回轮廓系数。
接下来,我们需要定义一个函数,用于搜索最佳参数组合。代码如下:
```python
def search_best_params():
best_eps = -1
best_min_samples = -1
best_score = -1
for eps in np.arange(0.1, 2.1, 0.1):
for min_samples in range(2, 11):
score = get_silhouette_score(eps, min_samples)
if score > best_score:
best_score = score
best_eps = eps
best_min_samples = min_samples
return best_eps, best_min_samples, best_score
```
在这个函数中,我们首先定义了三个变量,分别用于保存最佳的eps、min_samples和轮廓系数。然后,我们使用两个for循环遍历所有可能的参数组合,并调用get_silhouette_score函数计算对应的轮廓系数。如果新的轮廓系数比之前保存的最佳轮廓系数要高,则更新最佳参数组合和最佳轮廓系数。最后,返回最佳参数组合和最佳轮廓系数。
最后,我们可以调用search_best_params函数来搜索最佳参数组合,并输出结果。代码如下:
```python
best_eps, best_min_samples, best_score = search_best_params()
print("Best eps: ", best_eps)
print("Best min_samples: ", best_min_samples)
print("Best silhouette score: ", best_score)
```
这里我们使用了np.arange函数来生成一个包含所有可能的eps值的数组,这个数组的范围是从0.1到2.0,步长为0.1。对于min_samples,我们遍历了从2到10的所有可能取值。你也可以根据实际情况调整这些参数的范围和步长。
完整代码如下:
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