大型矩阵csr压缩存储fortran

时间: 2023-05-16 20:03:08 浏览: 59
CSR(Compressed Sparse Row)压缩存储格式是一种针对大型稀疏矩阵的存储方式。其中,稀疏矩阵指的是其中绝大部分元素为0的矩阵,而我们只需要存储矩阵中非零元素的值以及它们所在的位置,即行和列的索引。在CSR格式中,我们将矩阵分解成三个数组来存储其非零元素:一个值数组,一个列索引数组和一个行指针数组。值数组中存储非零元素的值,与之对应的是列索引数组,用来标记这些值所在的列。行指针数组则记录每个行中第一个非零元素位置在值数组中的下标,用来加速行的遍历。 在Fortran语言中,CSR格式的实现可以通过使用数组和指针来完成,其中数组用于存储矩阵的非零值和列索引,而指针则用于存储每行的起始位置。具体地,每行非零元素的个数可以用指针数组中相邻元素的差来表示。在实现上,程序需要先读取原始矩阵,并将其转换为CSR格式,并在程序中存储CSR格式矩阵时,可以将其分为三个变量:值数组、列索引数组和行指针数组。此外,我们还可以使用稀疏矩阵库,如MKL或者umfpack等,来简化和加速矩阵操作的实现。 总之,在Fortran语言中,我们可以通过使用CSR格式的压缩存储方式来高效地处理大型稀疏矩阵,提升程序的效率和性能。
相关问题

CSR稀疏矩阵压缩的宽度优先

CSR稀疏矩阵压缩是一种常用的稀疏矩阵存储格式,它将稀疏矩阵压缩为三个一维数组,包括非零元素的值、非零元素所在的列和每一行中第一个非零元素在值数组中的位置。在CSR稀疏矩阵压缩的基础上,可以使用宽度优先搜索算法(BFS)对稀疏矩阵进行遍历。 具体步骤如下: 1. 从起始节点开始,将其加入队列中。 2. 从队列中取出一个节点,遍历其邻居节点,将其加入队列中,并标记已访问。 3. 重复步骤2,直到队列为空。 在CSR稀疏矩阵压缩中,可以通过访问非零元素的列和每一行中第一个非零元素在值数组中的位置来确定节点和邻居节点之间的关系,从而实现宽度优先搜索。 需要注意的是,BFS算法需要使用队列来存储节点,因此在稀疏矩阵较大时需要考虑内存的使用问题。

适用于压缩存储稀疏矩阵的两种存储结构是:

1. 压缩行存储(CSR):将稀疏矩阵按行压缩存储,只存储非零元素及其列坐标和行指针。行指针记录每一行的第一个非零元素在压缩后的数组中的位置。该存储结构适用于行操作较多的情况。 2. 压缩列存储(CSC):将稀疏矩阵按列压缩存储,只存储非零元素及其行坐标和列指针。列指针记录每一列的第一个非零元素在压缩后的数组中的位置。该存储结构适用于列操作较多的情况。

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c #include <stdio.h> #include <stdlib.h> void lu_decomposition(double** a, int n, int* p) { int i, j, k, row; double max, temp; for (i = 0; i < n; i++) { p[i] = i; } for (i = 0; i < n; i++) { max = 0.0; row = i; for (j = i; j < n; j++) { if (abs(a[j][i]) > max) { max = abs(a[j][i]); row = j; } } if (max == 0.0) { printf("Singular matrix\n"); exit(EXIT_FAILURE); } if (row != i) { for (j = 0; j < n; j++) { temp = a[i][j]; a[i][j] = a[row][j]; a[row][j] = temp; } k = p[i]; p[i] = p[row]; p[row] = k; } for (j = i + 1; j < n; j++) { a[j][i] /= a[i][i]; for (k = i + 1; k < n; k++) { a[j][k] -= a[j][i] * a[i][k]; } } } } void lu_solve(double** a, double* b, int* p, int n, double* x) { int i, j; double sum; for (i = 0; i < n; i++) { x[i] = b[p[i]]; } for (i = 0; i < n; i++) { sum = x[i]; for (j = 0; j < i; j++) { sum -= a[i][j] * x[j]; } x[i] = sum; } for (i = n - 1; i >= 0; i--) { sum = x[i]; for (j = i + 1; j < n; j++) { sum -= a[i][j] * x[j]; } x[i] = sum / a[i][i]; } } int main() { int n = 3; double** a = (double**)malloc(n * sizeof(double*)); int i, j, k; for (i = 0; i < n; i++) { a[i] = (double*)malloc(n * sizeof(double)); } int* p = (int*)malloc(n * sizeof(int)); double* b = (double*)malloc(n * sizeof(double)); double* x = (double*)malloc(n * sizeof(double)); a[0][0] = 2.0; a[0][1] = 1.0; a[0][2] = 1.0; a[1][0] = 4.0; a[1][1] = 3.0; a[1][2] = 3.0; a[2][0] = 8.0; a[2][1] = 7.0; a[2][2] = 9.0; b[0] = 3.0; b[1] = 7.0; b[2] = 16.0; lu_decomposition(a, n, p); lu_solve(a, b, p, n, x); printf("Solution:\n"); for (i = 0; i < n; i++) { printf("%lf\n", x[i]); } for (i = 0; i < n; i++) { free(a[i]); } free(a); free(p); free(b); free(x); return 0; }
以下是使用选主元 LU 分解求解稀疏矩阵 Ax=b 的 C 代码: #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <math.h> #define N 100 // 矩阵的最大维数 #define eps 1e-10 // 用于判断是否为零的阈值 typedef struct { int i, j; double val; } node; int n; // 矩阵的维数 node a[N * N]; // 稀疏矩阵存储结构 int ia[N + 1], ja[N * N + 1]; // 行和列指针 // 选主元 LU 分解函数 void lu_decomp(double *A, int *ipiv) { int i, j, k, p; double maxa, tmp; for (i = 0; i < n; i++) { ipiv[i] = i; } for (k = 0; k < n - 1; k++) { maxa = fabs(A[k * n + k]); p = k; for (i = k + 1; i < n; i++) { if (fabs(A[i * n + k]) > maxa) { maxa = fabs(A[i * n + k]); p = i; } } if (p != k) { for (j = 0; j < n; j++) { tmp = A[k * n + j]; A[k * n + j] = A[p * n + j]; A[p * n + j] = tmp; } i = ipiv[k]; ipiv[k] = ipiv[p]; ipiv[p] = i; } for (i = k + 1; i < n; i++) { A[i * n + k] /= A[k * n + k]; for (j = k + 1; j < n; j++) { A[i * n + j] -= A[i * n + k] * A[k * n + j]; } } } } // LU 分解求解函数 void lu_solve(double *A, int *ipiv, double *b, double *x) { int i, j; double sum; for (i = 0; i < n; i++) { sum = b[ipiv[i]]; for (j = 0; j < i; j++) { sum -= A[i * n + j] * x[j]; } x[i] = sum; } for (i = n - 1; i >= 0; i--) { sum = x[i]; for (j = i + 1; j < n; j++) { sum -= A[i * n + j] * x[j]; } x[i] = sum / A[i * n + i]; } } int main() { int i, j, k, cnt = 0; double A[N][N], b[N], x[N]; int ipiv[N]; // 读入矩阵和向量 scanf("%d", &n); for (i = 0; i < n; i++) { for (j = 0; j < n; j++) { scanf("%lf", &A[i][j]); if (fabs(A[i][j]) > eps) { a[cnt].i = i; a[cnt].j = j; a[cnt].val = A[i][j]; cnt++; } } } for (i = 0; i < n; i++) { scanf("%lf", &b[i]); } // 构造行和列指针 k = 0; for (i = 0; i <= n; i++) { ia[i] = k; for (j = 0; j < n; j++) { if (a[k].i == i) { ja[k] = a[k].j; k++; } } } // LU 分解求解 lu_decomp(a, ipiv); lu_solve(a, ipiv, b, x); // 输出结果 for (i = 0; i < n; i++) { printf("%lf ", x[i]); } return 0; } 其中,稀疏矩阵存储结构使用了三元组表示法,同时构造了行和列指针。选主元 LU 分解的代码实现和普通的 LU 分解类似,只是在选主元时需要额外的代码。LU 分解求解的代码也和普通的 LU 分解类似,只是需要传入行和列指针。
以下是利用选主元LU分解求解CSR格式矩阵a的C代码: #include <stdio.h> #include <stdlib.h> typedef struct { int n; // 矩阵维数 int nnz; // 非零元素个数 double *val; // 非零元素 int *colind; // 列指标 int *rowptr; // 行指针 } csr_matrix; void lu_decomp(csr_matrix *a, int *perm, double *scale) { int n = a->n; int nnz = a->nnz; double *val = a->val; int *colind = a->colind; int *rowptr = a->rowptr; int i, j, k, imax; double max, tmp; for (i = 0; i < n; i++) { perm[i] = i; max = 0.0; for (j = rowptr[i]; j < rowptr[i+1]; j++) { if (abs(val[j]) > max) { max = abs(val[j]); } } if (max == 0.0) { printf("Error: zero pivot encountered\n"); exit(1); } scale[i] = 1.0 / max; } for (k = 0; k < n; k++) { max = 0.0; for (i = k; i < n; i++) { tmp = scale[i] * abs(val[rowptr[i]]); if (tmp > max) { max = tmp; imax = i; } } if (max == 0.0) { printf("Error: zero pivot encountered\n"); exit(1); } if (imax != k) { j = perm[k]; perm[k] = perm[imax]; perm[imax] = j; tmp = scale[k]; scale[k] = scale[imax]; scale[imax] = tmp; } for (i = k+1; i < n; i++) { tmp = val[rowptr[i]+k] / val[rowptr[k]+k]; val[rowptr[i]+k] = tmp; for (j = rowptr[k]+1; j < rowptr[k+1]; j++) { val[rowptr[i]+colind[j]] -= tmp * val[j]; } } } } void lu_solve(csr_matrix *a, int *perm, double *scale, double *b, double *x) { int n = a->n; double *val = a->val; int *colind = a->colind; int *rowptr = a->rowptr; int i, j; double sum; for (i = 0; i < n; i++) { x[i] = b[perm[i]]; } for (i = 0; i < n; i++) { sum = x[i]; for (j = rowptr[i]; j < rowptr[i+1]; j++) { sum -= val[j] * x[colind[j]]; } x[i] = sum; } for (i = n-1; i >= 0; i--) { sum = x[i]; for (j = rowptr[i]+1; j < rowptr[i+1]; j++) { sum -= val[j] * x[colind[j]]; } x[i] = sum / val[rowptr[i]]; } for (i = 0; i < n; i++) { x[perm[i]] = x[i]; } } int main() { csr_matrix a = {5, 13, (double []){1.0, 2.0, 3.0, 4.0, 5.0, 6.0, 7.0, 8.0, 9.0, 10.0, 11.0, 12.0, 13.0}, (int []){0, 1, 2, 3, 4, 0, 1, 2, 3, 1, 2, 3, 4}, (int []){0, 5, 8, 10, 11, 13}}; int perm[5]; double scale[5]; double b[5] = {1.0, 2.0, 3.0, 4.0, 5.0}; double x[5]; lu_decomp(&a, perm, scale); lu_solve(&a, perm, scale, b, x); printf("Solution: "); for (int i = 0; i < 5; i++) { printf("%g ", x[i]); } printf("\n"); return 0; } 其中,csr_matrix 结构体存储了 CSR 格式的矩阵,lu_decomp 函数通过选主元 LU 分解求解矩阵,lu_solve 函数利用 LU 分解求解线性方程组。在主函数中,我们构造了一个 5x5 的 CSR 格式矩阵,并利用 LU 分解求解了线性方程组。
### 回答1: Torch 中的稀疏矩阵可以使用 COO (Coordinate) 或 CSR (Compressed Sparse Row) 格式进行表达。COO 格式将矩阵中非零元素的坐标和值分别存储在三个数组中,而 CSR 格式则将非零元素的值和列坐标分别存储在两个数组中,同时使用一个指针数组来记录每行的起始位置。这些格式可以通过 torch.sparse 模块中的函数进行创建和操作。 ### 回答2: 在PyTorch中,稀疏矩阵可以通过torch.sparse模块进行表示和操作。稀疏矩阵是指矩阵中绝大部分元素为零的情况,为了提高存储和计算效率,可以使用稀疏矩阵来表示。在torch.sparse模块中,有两种主要的稀疏矩阵表示方法,分别是COO(坐标格式)和CSR(压缩稀疏行格式)。 COO格式是一种简洁的表示方法,它通过三个Tensor来表示稀疏矩阵的非零元素的行、列以及对应的值。例如,可以通过torch.sparse_coo_tensor函数来创建一个COO格式的稀疏矩阵。创建时需要指定非零元素的行、列和值,以及矩阵的形状。 CSR格式则是一种更为紧凑的表示方法,它使用两个Tensor来表示稀疏矩阵。第一个Tensor存储了每一行中的非零元素在第二个Tensor中的起始位置,第二个Tensor存储了所有的非零元素,并按照行的顺序排列。通过torch.sparse_csr_tensor函数可以创建一个CSR格式的稀疏矩阵。 在使用稀疏矩阵时,可以通过torch.sparse.mm函数进行稀疏矩阵与稠密矩阵的乘法运算,该函数会根据输入的稀疏矩阵的格式自动选择最优的计算方式。另外,可以通过.to_dense方法将稀疏矩阵转换为稠密矩阵进行进一步的操作。 总之,PyTorch的torch.sparse模块提供了对稀疏矩阵的支持,可以方便地进行表示和操作。稀疏矩阵的使用可以有效减少内存消耗,并提高计算效率。 ### 回答3: 在 Torch 中,稀疏矩阵是一种特殊类型的矩阵,其中大部分元素是零。为了有效地存储和处理这些矩阵,Torch 提供了一种称为 COO(Coordinate List)格式的稀疏矩阵表达方式。 在 COO 格式中,一个稀疏矩阵可以用三个数组来表示,分别是行索引数组、列索引数组和值数组。行索引数组存储非零元素所在的行,列索引数组存储非零元素所在的列,而值数组存储对应的非零元素的值。由于只存储非零元素的位置和值,因此 COO 格式能够显著减少对存储空间的需求。 举例来说,假设我们有一个3x3的矩阵M,其中非零元素为(1, 2, 3),它们的位置分别是(0, 1, 2)对应的行和(1, 2, 0)对应的列。在 COO 格式下,矩阵 M 可以表示为以下三个数组: - 行索引数组:[0, 1, 2] - 列索引数组:[1, 2, 0] - 值数组:[1, 2, 3] 使用 Torch 提供的稀疏矩阵操作函数,可以对 COO 格式下的稀疏矩阵进行各种常见操作,如矩阵加法、乘法、转置等。同时,Torch 也支持将 COO 格式的稀疏矩阵转换为其他格式(如 CSR、CSC)进行存储和计算,以满足不同情况下的需求。 总结来说,Torch 中的稀疏矩阵可以使用 COO 格式进行表达,使用三个数组分别表示非零元素的位置和值。这种表达方式能够有效减少存储空间,并提供了丰富的稀疏矩阵操作函数,使得在处理稀疏矩阵时更加高效。

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