对sklearn内置的乳腺癌数据集进行PCA降维,并可视化的代码

时间: 2023-06-15 14:04:10 浏览: 257
以下是对sklearn内置的乳腺癌数据集进行PCA降维,并可视化的Python代码: ```python from sklearn.datasets import load_breast_cancer from sklearn.decomposition import PCA import matplotlib.pyplot as plt # 加载乳腺癌数据集 data = load_breast_cancer().data # 对数据进行PCA降维 pca = PCA(n_components=2) reduced_data = pca.fit_transform(data) # 绘制降维后的数据 plt.scatter(reduced_data[:, 0], reduced_data[:, 1], c=load_breast_cancer().target) plt.xlabel('PCA Component 1') plt.ylabel('PCA Component 2') plt.show() ``` 这段代码中,我们首先通过`load_breast_cancer()`函数加载了乳腺癌数据集,然后使用`PCA`类对数据进行降维。在这里,我们将数据降到了2个维度,即`n_components=2`。最后,我们使用`matplotlib`库将降维后的数据可视化。其中,颜色表示数据点所对应的类别,0代表恶性肿瘤,1代表良性肿瘤。
相关问题

对乳腺癌数据集进行PCA降维,并可视化的代码

首先需要导入数据集和需要的库: ```python import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.preprocessing import StandardScaler # 读取数据集 data = pd.read_csv('breast_cancer.csv') # 去除无用列 data.drop(['id', 'Unnamed: 32'], axis=1, inplace=True) # 将M和B转换成数字 data.diagnosis = data.diagnosis.map({'M':1, 'B':0}) # 分离标签和特征 X = data.iloc[:, 1:].values y = data.iloc[:, 0].values ``` 接着进行特征缩放,将数据集进行标准化: ```python scaler = StandardScaler() X = scaler.fit_transform(X) ``` 然后进行PCA降维: ```python pca = PCA(n_components=2) X_pca = pca.fit_transform(X) ``` 最后进行可视化: ```python plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], c=y) plt.xlabel('First Principal Component') plt.ylabel('Second Principal Component') plt.show() ``` 完整代码如下: ```python import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.preprocessing import StandardScaler # 读取数据集 data = pd.read_csv('breast_cancer.csv') # 去除无用列 data.drop(['id', 'Unnamed: 32'], axis=1, inplace=True) # 将M和B转换成数字 data.diagnosis = data.diagnosis.map({'M':1, 'B':0}) # 分离标签和特征 X = data.iloc[:, 1:].values y = data.iloc[:, 0].values # 特征缩放 scaler = StandardScaler() X = scaler.fit_transform(X) # PCA降维 pca = PCA(n_components=2) X_pca = pca.fit_transform(X) # 可视化 plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], c=y) plt.xlabel('First Principal Component') plt.ylabel('Second Principal Component') plt.show() ``` 这样就可以得到一个二维的可视化结果,表示乳腺癌数据集的降维情况。

使用PCA、Isomap对乳腺癌数据集进行降维并进行可视化

好的,我可以为您解答这个问题。 首先,我们需要加载乳腺癌数据集,并将其分为特征和标签。 ```python from sklearn.datasets import load_breast_cancer import numpy as np data = load_breast_cancer() X = data.data y = data.target ``` 接下来,我们使用PCA和Isomap对数据进行降维,并将结果可视化。 ```python import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.manifold import Isomap # 使用PCA进行降维 pca = PCA(n_components=2) X_pca = pca.fit_transform(X) # 使用Isomap进行降维 isomap = Isomap(n_components=2) X_isomap = isomap.fit_transform(X) # 可视化PCA和Isomap的结果 plt.figure(figsize=(10, 5)) plt.subplot(121) plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], c=y) plt.title('PCA') plt.subplot(122) plt.scatter(X_isomap[:, 0], X_isomap[:, 1], c=y) plt.title('Isomap') plt.show() ``` 这段代码将会生成一个大小为10x5的画布,其中包含两个子图。左边的子图显示了使用PCA进行降维后的结果,右边的子图显示了使用Isomap进行降维后的结果。每个数据点的颜色表示其所属的类别。 您可以根据需要进一步调整PCA和Isomap的参数,以达到更好的降维效果。

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