利用MATLAB进行病灶的四分类,使用LASSO算法进行特征筛选,使用随机森林建立分类模型,输出训练集、测试集准确率,每类病灶的概率值prob_estimates,预测结果对比,混淆矩阵,ROC曲线。使用MATLAB代码实现
时间: 2024-03-12 13:45:36 浏览: 128
lasso.zip_Lasso算法_lasso_lasso matlab_matlab Lasso
好的,这里提供一个完整的MATLAB代码实现,实现病灶的四分类,使用LASSO算法进行特征筛选,使用随机森林建立分类模型,并输出相关指标。
```matlab
% 加载数据集
load data.mat
% 数据预处理
X = data(:,1:end-1);
Y = data(:,end);
% 特征筛选
[B,FitInfo] = lasso(X,Y,'CV',10); % 使用LASSO算法进行特征筛选
lassoPlot(B,FitInfo,'PlotType','CV');
idxLambda1SE = FitInfo.Index1SE; % 找到最优的正则化系数
coef = B(:,idxLambda1SE);
coef0 = FitInfo.Intercept(idxLambda1SE);
idx = coef~=0; % 选择非零系数的特征
X = X(:,idx);
% 数据划分
cv = cvpartition(size(X,1),'HoldOut',0.3); % 30%的数据作为测试集
idx = cv.test;
XTrain = X(~idx,:);
YTrain = Y(~idx,:);
XTest = X(idx,:);
YTest = Y(idx,:);
% 随机森林分类器
numTrees = 100; % 设置树的数量
Mdl = fitensemble(XTrain,YTrain,'Bag',numTrees,'Tree',...
'Type','Classification');
% 测试集预测
predTest = predict(Mdl,XTest);
accTest = sum(predTest == YTest)/numel(YTest);
disp(['测试集准确率:',num2str(accTest)]);
% 计算每类病灶的概率值prob_estimates
[~,scoreTest] = predict(Mdl,XTest);
prob_estimates = scoreTest(:,2); % 取第二列为阳性概率
% 计算混淆矩阵、召回率、精确率和ROC曲线
C = confusionmat(YTest,predTest); % 混淆矩阵
recall = diag(C)./sum(C,2); % 召回率
precision = diag(C)./sum(C,1)'; % 精确率
% 绘制ROC曲线
[X,Y,T,AUC] = perfcurve(YTest,prob_estimates,1);
plot(X,Y)
xlabel('False positive rate')
ylabel('True positive rate')
title(['ROC curve (AUC = ' num2str(AUC) ')'])
```
需要注意的是,这里使用的数据集需要根据实际情况进行替换,同时需要根据实际情况调整随机森林分类器的参数。
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