给一个Data,用coxph做完生存分析后,画图对比不同Group的生存概率图像,只有一个变量Group,Group里面只有1和2。我想绘制的是cox结果的拟合图像和KM估计的对比,Cox和KM估计的图像需要画在同一张图里
时间: 2024-05-15 10:12:22 浏览: 96
首先,我们需要加载必要的包和数据。假设数据名为`mydata`,其中`Group`是分组变量,`Time`是时间变量,`Event`是事件变量。
```R
library(survival)
library(ggplot2)
mydata <- read.csv("mydata.csv")
```
接下来,我们使用`coxph`函数来拟合Cox比例风险模型,并使用`survfit`函数来估计Kaplan-Meier生存曲线。这里我们将两个结果分别存储在`cox_model`和`km_model`中。
```R
cox_model <- coxph(Surv(Time, Event) ~ Group, data = mydata)
km_model <- survfit(Surv(Time, Event) ~ Group, data = mydata)
```
然后,我们可以使用`autoplot`函数从`ggfortify`包中绘制Kaplan-Meier生存曲线。这里我们将Kaplan-Meier曲线的颜色设置为蓝色。
```R
library(ggfortify)
km_plot <- autoplot(km_model, conf.int = FALSE, surv.col = "blue")
```
接下来,我们使用`survfit.coxph`函数从`survminer`包中绘制Cox比例风险模型的拟合曲线。这里我们将Cox比例风险模型的颜色设置为红色。
```R
library(survminer)
cox_plot <- ggsurvplot(survfit.coxph(cox_model), data = mydata, conf.int = FALSE, surv.col = "red")
```
最后,我们可以使用`grid.arrange`函数从`gridExtra`包中将两个图像组合在一起。
```R
library(gridExtra)
grid.arrange(km_plot, cox_plot, ncol = 2)
```
这样就可以得到一个包含Cox模型拟合曲线和Kaplan-Meier曲线的图像。
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