写一段代码 要求能用PyQt结合VTK读取指定的.dcm序列文件,将其转换成.nii.gz文件并做三维可视化
时间: 2024-05-01 11:16:14 浏览: 209
VTK读取.vtk格式文件,并3维显示
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以下是示例代码:
```python
import vtk
import numpy as np
import SimpleITK as sitk
from PyQt5.QtWidgets import QApplication, QWidget, QFileDialog, QVBoxLayout
from vtk.qt.QVTKRenderWindowInteractor import QVTKRenderWindowInteractor
class DicomViewer(QWidget):
def __init__(self):
super().__init__()
# 创建VTK渲染窗口
self.vtkWidget = QVTKRenderWindowInteractor(self)
self.vtkWidget.Initialize()
self.vtkWidget.Start()
# 创建PyQt布局
layout = QVBoxLayout()
layout.addWidget(self.vtkWidget)
self.setLayout(layout)
# 设置窗口标题和大小
self.setWindowTitle('Dicom Viewer')
self.setGeometry(100, 100, 800, 600)
# 打开.dcm序列文件
options = QFileDialog.Options()
options |= QFileDialog.DontUseNativeDialog
fileName, _ = QFileDialog.getOpenFileName(self, "Open DICOM Directory", "",
"DICOM Files (*.dcm)", options=options)
if fileName:
# 读取.dcm序列文件
reader = vtk.vtkDICOMImageReader()
reader.SetDirectoryName(fileName)
reader.Update()
# 获取图像数据
imageData = reader.GetOutput()
# 将VTK图像数据转换成SimpleITK图像数据
sitkImage = sitk.GetImageFromArray(vtk.util.numpy_support.vtk_to_numpy(imageData.GetPointData().GetScalars()).reshape(
imageData.GetDimensions()[::-1]).transpose())
sitkImage.SetSpacing(imageData.GetSpacing()[::-1])
# 保存为.nii.gz文件
sitk.WriteImage(sitkImage, 'output.nii.gz')
# 创建VTK渲染器和窗口
renderer = vtk.vtkRenderer()
self.vtkWidget.GetRenderWindow().AddRenderer(renderer)
# 创建VTK图像数据显示对象
mapper = vtk.vtkImageMapper()
mapper.SetInputData(imageData)
actor = vtk.vtkActor2D()
actor.SetMapper(mapper)
# 将VTK图像数据显示对象添加到VTK渲染器中
renderer.AddActor(actor)
renderer.ResetCamera()
if __name__ == '__main__':
app = QApplication([])
window = DicomViewer()
window.show()
app.exec_()
```
这段代码可以在PyQt界面中打开.dcm序列文件,并将其转换为.nii.gz文件。同时,它还使用VTK进行三维可视化,并将VTK渲染窗口嵌入到PyQt界面中。您可以根据需要对代码进行修改。
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