写一段代码 要求能用PyQt结合VTK读取指定的.dcm文件,将其转换成.nii.gz文件并做三维可视化

时间: 2024-05-10 17:21:25 浏览: 15
以下是一个示例代码,可以使用PyQt和VTK读取指定的.dcm文件,将其转换为.nii.gz文件,并进行三维可视化: ```python import vtk import numpy as np import SimpleITK as sitk from PyQt5.QtWidgets import QApplication, QMainWindow, QFileDialog, QWidget, QVBoxLayout from vtk.qt.QVTKRenderWindowInteractor import QVTKRenderWindowInteractor class MainWindow(QMainWindow): def __init__(self): super().__init__() self.setWindowTitle("DICOM to NIFTI Converter and Viewer") self.setGeometry(100, 100, 800, 600) self.central_widget = QWidget(self) self.setCentralWidget(self.central_widget) self.vtk_widget = QVTKRenderWindowInteractor(self.central_widget) self.layout = QVBoxLayout(self.central_widget) self.layout.addWidget(self.vtk_widget) self.reader = vtk.vtkDICOMImageReader() self.renderer = vtk.vtkRenderer() self.vtk_widget.GetRenderWindow().AddRenderer(self.renderer) self.renWin = self.vtk_widget.GetRenderWindow() self.interactor = self.renWin.GetInteractor() self.interactor.SetInteractorStyle(vtk.vtkInteractorStyleTrackballCamera()) self.interactor.SetRenderWindow(self.renWin) self.file_dialog = QFileDialog(self.central_widget) self.file_dialog.setNameFilter("DICOM files (*.dcm)") self.file_dialog.fileSelected.connect(self.load_dicom) self.menu_bar = self.menuBar() self.file_menu = self.menu_bar.addMenu("File") self.open_file_action = self.file_menu.addAction("Open DICOM file") self.open_file_action.triggered.connect(self.file_dialog.exec_) self.convert_to_nifti_action = self.file_menu.addAction("Convert to NIFTI") self.convert_to_nifti_action.triggered.connect(self.convert_to_nifti) def load_dicom(self, filename): self.reader.SetDirectoryName(filename) self.reader.Update() image_data = self.reader.GetOutput() extent = image_data.GetExtent() mapper = vtk.vtkFixedPointVolumeRayCastMapper() mapper.SetInputData(image_data) volume = vtk.vtkVolume() volume.SetMapper(mapper) self.renderer.AddVolume(volume) self.renderer.ResetCamera() self.renWin.Render() def convert_to_nifti(self): filename, _ = self.file_dialog.getSaveFileName(self.central_widget, "Save NIFTI file", "", "NIFTI files (*.nii.gz)") if filename: image_data = self.reader.GetOutput() array = vtk.util.numpy_support.vtk_to_numpy(image_data.GetPointData().GetScalars()) array = np.reshape(array, image_data.GetDimensions(), order='F') sitk_image = sitk.GetImageFromArray(array) sitk_image.SetSpacing(image_data.GetSpacing()) sitk_image.SetOrigin(image_data.GetOrigin()) sitk_image.SetDirection(image_data.GetDirection()) sitk.WriteImage(sitk_image, filename) print("Converted to NIFTI:", filename) if __name__ == "__main__": app = QApplication([]) window = MainWindow() window.show() app.exec_() ``` 运行此代码后,将打开一个具有菜单栏的窗口。单击“文件”菜单中的“打开DICOM文件”选项,选择要加载的.dcm文件。加载DICOM文件后,将在窗口中显示三维可视化。单击“文件”菜单中的“转换为NIFTI”选项,选择要将DICOM文件转换为的.nii.gz文件的路径。转换完成后,将在控制台中显示“已转换为NIFTI:”和文件路径。

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