用dgl输出图的邻接矩阵
时间: 2023-03-29 16:01:45 浏览: 379
可以使用dgl库中的函数dgl.to_scipy_sparse_matrix()将图转换为稀疏矩阵,然后使用scipy.sparse库中的函数toarray()将稀疏矩阵转换为邻接矩阵。具体代码如下:
import dgl
import scipy.sparse as sp
# 构建图
g = dgl.graph(([, 1, 2, 3], [1, 2, 3, ]))
# 将图转换为稀疏矩阵
adj = dgl.to_scipy_sparse_matrix(g)
# 将稀疏矩阵转换为邻接矩阵
adj = adj.toarray()
print(adj)
相关问题
dgl赋值g邻接矩阵
你可以使用DGL库来完成对DGL图对象g的邻接矩阵赋值。下面是一个示例代码:
```python
import dgl
import torch
# 创建一个空的DGL图对象
g = dgl.DGLGraph()
# 添加节点
g.add_nodes(5)
# 添加边
src = [0, 1, 2, 3, 4]
dst = [1, 2, 3, 4, 0]
g.add_edges(src, dst)
# 创建邻接矩阵
adj_matrix = torch.zeros((5, 5))
# 遍历图中的边,将邻接矩阵中对应位置置为1
for src, dst in zip(g.edges()[0], g.edges()[1]):
adj_matrix[src][dst] = 1
print(adj_matrix)
```
这个示例代码中,我们首先使用DGL库创建了一个包含5个节点的图对象g,然后添加了一些边。接下来,我们创建了一个5x5的零矩阵adj_matrix,遍历图中的边,并将邻接矩阵中对应位置置为1。最后打印出邻接矩阵adj_matrix。
请注意,这只是一个简单的示例,实际上DGL库提供了更多强大的功能来操作和处理图数据。你可以根据自己的需求进行进一步的操作和扩展。
dgl 加载bin文件,获得邻接矩阵
要加载一个bin文件并获得邻接矩阵,可以使用dgl提供的load_graphs函数。具体步骤如下:
1. 导入dgl和pickle模块:
```python
import dgl
import pickle
```
2. 使用pickle.load函数加载bin文件中的图数据:
```python
with open('graph.bin', 'rb') as f:
graph_data = pickle.load(f)
```
3. 将图数据转换为dgl图对象:
```python
graph = dgl.graph(graph_data['edge_index'])
```
4. 调用dgl.graph中的to_dense()方法,将邻接矩阵转换为稠密矩阵:
```python
adj_matrix = graph.adjacency_matrix().to_dense()
```
至此,您就可以获得邻接矩阵了。需要注意的是,如果您的图是有向图,则需要在创建dgl图对象时指定参数is_directed=True。
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