dgl 加载bin文件,获得邻接矩阵,不允许使用adj_matrix = graph.adjacency_matrix()

时间: 2024-03-02 15:48:26 浏览: 26
如果您不想使用`adj_matrix = graph.adjacency_matrix()`来获得邻接矩阵,可以使用以下方法: 方法一:使用`dgl.to_networkx`将dgl图对象转换为NetworkX图对象,然后使用NetworkX提供的方法获得邻接矩阵: ```python import dgl import networkx as nx import numpy as np with open('graph.bin', 'rb') as f: graph_data = np.load(f, allow_pickle=True) graph = dgl.graph((graph_data['edge_index'][0], graph_data['edge_index'][1])) nx_graph = dgl.to_networkx(graph) adj_matrix = nx.adjacency_matrix(nx_graph) ``` 方法二:使用`dgl.to_scipy`将邻接矩阵转换为稀疏矩阵,然后使用`toarray()`方法将稀疏矩阵转换为稠密矩阵: ```python import dgl import numpy as np with open('graph.bin', 'rb') as f: graph_data = np.load(f, allow_pickle=True) graph = dgl.graph((graph_data['edge_index'][0], graph_data['edge_index'][1])) adj_matrix = dgl.to_scipy(graph.adjacency_matrix()) dense_matrix = adj_matrix.toarray() ``` 需要注意的是,这两种方法都会将邻接矩阵转换为稠密矩阵,如果邻接矩阵过大,可能会导致内存溢出或性能问题。如果需要处理大规模的邻接矩阵,建议使用稀疏矩阵进行计算。

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程序运行提示QBasicTimer::stop: Failed. Possibly trying to stop from a different thread,修改程序class MyWindow(QWidget): def init(self): super().init() self.thread_list = [] self.color_photo_dir = os.path.join(os.getcwd(), "color_photos") self.depth_photo_dir = os.path.join(os.getcwd(), "depth_photos") self.image_thread = None self.saved_color_photos = 0 # 定义 saved_color_photos 属性 self.saved_depth_photos = 0 # 定义 saved_depth_photos 属性 self.init_ui() def init_ui(self): self.ui = uic.loadUi("C:/Users/wyt/Desktop/D405界面/intelrealsense1.ui") self.open_btn = self.ui.pushButton self.color_image_chose_btn = self.ui.pushButton_3 self.depth_image_chose_btn = self.ui.pushButton_4 self.open_btn.clicked.connect(self.open) self.color_image_chose_btn.clicked.connect(lambda: self.chose_dir(self.ui.lineEdit, "color")) self.depth_image_chose_btn.clicked.connect(lambda: self.chose_dir(self.ui.lineEdit_2, "depth")) def open(self): self.profile = self.pipeline.start(self.config) self.is_camera_opened = True self.label.setText('相机已打开') self.label.setStyleSheet('color:green') self.open_btn.setEnabled(False) self.close_btn.setEnabled(True) self.image_thread = ImageThread(self.pipeline, self.color_label, self.depth_label, self.interval, self.color_photo_dir, self.depth_photo_dir, self._dgl) self.image_thread.saved_color_photos_signal.connect(self.update_saved_color_photos_label) self.image_thread.saved_depth_photos_signal.connect(self.update_saved_depth_photos_label) self.image_thread.start() def chose_dir(self, line_edit, button_type): my_thread = MyThread(line_edit, button_type) my_thread.finished_signal.connect(self.update_line_edit) self.thread_list.append(my_thread) my_thread.start()

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import dgl import numpy as np import torch import torch.nn as nn import dgl.function as fn # 生成10个节点和15条边的图 g = dgl.rand_graph(10, 15) # 为每个节点随机生成一个特征向量 feat = np.random.rand(10, 5) # 为每条边随机生成一个特征向量 e_feat = np.random.rand(15, 3) # 将特征向量添加到图中 g.ndata['feat'] = torch.from_numpy(feat) g.edata['e_feat'] =torch.from_numpy(e_feat) # 随机给每个节点分配一个标签 labels = np.random.randint(0, 3, size=(10,)) g.ndata['label'] = torch.from_numpy(labels) class GraphSAGE(nn.Module): def __init__(self, in_feats, h_feats, num_classes): super(GraphSAGE, self).__init__() self.conv1 = dgl.nn.SAGEConv(in_feats, h_feats, 'mean') self.conv2 = dgl.nn.SAGEConv(h_feats, num_classes, 'mean') def forward(self, g, in_feat): h = self.conv1(g, in_feat) h = torch.relu(h) h = self.conv2(g, h) g.ndata['h'] = h hg = dgl.mean_nodes(g, 'h') return hg # 定义超参数 in_feats = 5 h_feats = 10 num_classes = 3 lr = 0.01 num_epochs = 20 # 创建模型和优化器 model = GraphSAGE(in_feats, h_feats, num_classes) optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=lr) # 训练模型 for epoch in range(num_epochs): logits = model(g, g.ndata['feat']) labels = g.ndata['label'] loss = nn.CrossEntropyLoss()(logits, labels) optimizer.zero_grad() loss.backward() optimizer.step() print('Epoch %d | Loss: %.4f' % (epoch, loss.item())) # 预测 model.eval() with torch.no_grad(): logits = model(g, g.ndata['feat']) pred = logits.argmax(1) print('Predicted labels:', pred) 报错:RuntimeError: expected scalar type Double but found Float

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