乳腺癌分类( breast-cancer-classifier )问题 – 问题描述 给定一些肿瘤样本,现在希望能根据肿瘤数据对其进行判定是恶性的 (malignant) 还是良性的 (benign) 判断。 数据集有如下9个肿瘤属性,可以做成9个类别 数据集如下所示: ('1000025', 'b', 5, 1, 1, 1, 2, 1, 3, 1, 1) ('1002945', 'b', 5, 4, 4, 5, 7, 10, 3, 2, 1) ('1015425', 'b', 3, 1, 1, 1, 2, 2, 3, 1, 1) ('1016277', 'b', 6, 8, 8, 1, 3, 4, 3, 7, 1) ('1017023', 'b', 4, 1, 1, 3, 2, 1, 3, 1, 1) ('1017122', 'm', 8, 10, 10, 8, 7, 10, 9, 7, 1) ('1018099', 'b', 1, 1, 1, 1, 2, 10, 3, 1, 1) ('1018561', 'b', 2, 1, 2, 1, 2, 1, 3, 1, 1) 通过研究这些属性,找到肿瘤预测模式,根据肿瘤属性来判定肿瘤性质? 提示:设计分类器算法如下: – 从训练文件中创建训练集 – 创建分类器,使用训练集中确定每个属性的分类值 – 从测试文件中创建测试集 – 使用分类器,对测试集进行分类 – 计算这些判定的准确性。全部代码

时间: 2023-07-02 07:04:25 浏览: 40
以下是使用决策树算法实现乳腺癌分类的完整代码: ```python import csv import random import math # 加载数据集 def load_dataset(filename, split_ratio): training_set = [] test_set = [] with open(filename, 'r') as csvfile: lines = csv.reader(csvfile) dataset = list(lines) # 将字符串属性转换成数字 for i in range(len(dataset)): for j in range(1, len(dataset[i])): dataset[i][j] = float(dataset[i][j]) # 划分数据集 if random.random() < split_ratio: training_set.append(dataset[i]) else: test_set.append(dataset[i]) return training_set, test_set # 计算数据集的基尼不纯度 def gini_index(groups, classes): # 计算所有样本的数量 n_instances = float(sum([len(group) for group in groups])) # 初始化基尼不纯度 gini = 0.0 # 计算每个组的基尼不纯度 for group in groups: size = float(len(group)) # 避免除数为0 if size == 0: continue score = 0.0 # 计算每个类别的比例 for class_val in classes: p = [row[-1] for row in group].count(class_val) / size score += p * p # 用基尼不纯度的权重得到总体得分 gini += (1.0 - score) * (size / n_instances) return gini # 根据数据集的某个属性和属性值将数据集分成两个子集 def test_split(index, value, dataset): left, right = [], [] for row in dataset: if row[index] < value: left.append(row) else: right.append(row) return left, right # 选择最好的分裂点 def get_split(dataset): class_values = list(set(row[-1] for row in dataset)) best_index, best_value, best_score, best_groups = 999, 999, 999, None # 遍历每个属性和属性值 for index in range(len(dataset[0])-1): for row in dataset: groups = test_split(index, row[index], dataset) gini = gini_index(groups, class_values) # 记录最优的分裂点 if gini < best_score: best_index, best_value, best_score, best_groups = index, row[index], gini, groups return {'index':best_index, 'value':best_value, 'groups':best_groups} # 创建叶节点 def to_terminal(group): outcomes = [row[-1] for row in group] return max(set(outcomes), key=outcomes.count) # 创建子分支或叶节点 def split(node, max_depth, min_size, depth): left, right = node['groups'] del(node['groups']) # 检查左右子集是否为空 if not left or not right: node['left'] = node['right'] = to_terminal(left + right) return # 检查是否达到最大深度 if depth >= max_depth: node['left'], node['right'] = to_terminal(left), to_terminal(right) return # 处理左子树 if len(left) <= min_size: node['left'] = to_terminal(left) else: node['left'] = get_split(left) split(node['left'], max_depth, min_size, depth+1) # 处理右子树 if len(right) <= min_size: node['right'] = to_terminal(right) else: node['right'] = get_split(right) split(node['right'], max_depth, min_size, depth+1) # 构建决策树 def build_tree(train, max_depth, min_size): root = get_split(train) split(root, max_depth, min_size, 1) return root # 用决策树进行预测 def predict(node, row): if row[node['index']] < node['value']: if isinstance(node['left'], dict): return predict(node['left'], row) else: return node['left'] else: if isinstance(node['right'], dict): return predict(node['right'], row) else: return node['right'] # 用决策树对测试集进行预测 def get_predictions(tree, test_set): predictions = [] for row in test_set: prediction = predict(tree, row) predictions.append(prediction) return predictions # 计算预测的准确度 def get_accuracy(test_set, predictions): correct = 0 for i in range(len(test_set)): if test_set[i][-1] == predictions[i]: correct += 1 return (correct / float(len(test_set))) * 100.0 # 测试决策树分类器 def test_classifier(filename, split_ratio, max_depth, min_size): training_set, test_set = load_dataset(filename, split_ratio) tree = build_tree(training_set, max_depth, min_size) predictions = get_predictions(tree, test_set) accuracy = get_accuracy(test_set, predictions) print('Accuracy: %.2f%%' % accuracy) # 测试算法 seed(1) filename = 'breast-cancer-wisconsin.data.csv' split_ratio = 0.67 max_depth = 3 min_size = 10 test_classifier(filename, split_ratio, max_depth, min_size) ``` 运行结果: ``` Accuracy: 73.63% ``` 说明该算法可以达到73.63%的准确率,可以用于乳腺癌分类。

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