为什么blast的结果不理性

Blast（Basic Local Alignment Search Tool）是一种常用的生物信息学工具，用于比对查询序列与数据库中已知序列的相似性。Blast的结果可能不理性的原因有很多，以下是一些可能的原因：

1. 数据库不完整或过时：Blast的结果依赖于数据库中已知序列的质量和数量。如果数据库中的序列不完整或过时，Blast的结果可能不理性。
2. 参数设置不合理：Blast有很多参数可以设置，如比对算法、匹配得分和惩罚等。如果参数设置不合理，Blast的结果可能不理性。
3. 查询序列质量差：如果查询序列质量差，如含有噪音或低质量区域，Blast的结果可能不理性。
4. 相似性过于接近：如果数据库中已知序列之间的相似性过于接近，Blast的结果可能不理性，因为可能会出现多个序列都与查询序列相似度很高的情况，这时很难确定最优的匹配结果。

以上是一些可能导致Blast结果不理性的原因，需要具体情况具体分析。

相关问题

如何查看blast结果

### 回答1：
要查看BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）的结果，您需要按照以下步骤进行操作：

1. 打开您的BLAST搜索结果页面，您将看到一张表格，其中包含有关您的查询序列和匹配序列的信息。
2. 在结果页面上，您将看到有关每个匹配的统计信息，例如匹配的得分、匹配的长度、匹配的相似性和匹配的标识性等。
3. 您还可以查看比对的序列。通常，您将看到在匹配序列和查询序列之间的线性比对，其中相同的氨基酸或核苷酸用相同的颜色进行突出显示。
4. 如果您需要下载结果，请查看结果页面上的下载选项，并选择您需要下载的文件格式。
5. 您还可以根据需要对结果进行过滤和排序。例如，您可以按照匹配得分、匹配长度或匹配的相似性对结果进行排序，以便更轻松地查找与您的查询序列最相似的匹配。

希望这可以帮助您查看和理解BLAST的搜索结果！

### 回答2：
在使用BLAST（基本局部序列比对搜索工具）后，可以通过多种方法查看结果。

首先，BLAST提供了网页界面，可以通过输入查询序列后点击搜索按钮，BLAST会运行并生成搜索结果页面。在网页结果中，可以看到多个信息栏，包括查询序列、匹配到的序列、比对得分、比对长度、相似性等。用户可以通过点击查询序列名或更多详细信息的链接来进一步查看每个匹配结果的详细信息。

另外，BLAST还提供了命令行接口，它允许用户通过使用命令行参数运行BLAST并将结果保存在输出文件中。用户可以指定输出格式为文本（例如CSV或XML），然后通过打开输出文件来查看结果。此外，一些BLAST程序还支持直接在终端显示结果。

除了BLAST自带的界面和命令行接口外，还有一些第三方工具可用于可视化和解释BLAST结果。例如，NCBI的BLAST在线工具提供了交互性更强、更直观的结果浏览功能。另外，也有一些开源软件如BioPython库和Bioconductor包可用于处理和分析BLAST结果。

总之，查看BLAST结果可以通过BLAST的网页界面、命令行接口、第三方工具等多种方式实现。用户可以根据自己的需求和偏好选择合适的方法来查看和解释BLAST结果。

### 回答3：
要查看BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）的结果，可以按照以下步骤进行。

首先，你需要进行BLAST分析并获得结果。这可以通过在NCBI（National Center for Biotechnology Information）网站上使用BLAST工具来完成。在网站上选择适当的BLAST程序（如BLASTn用于核酸序列比对，BLASTp用于蛋白质序列比对等）并将你的查询序列输入到相应的框中。设置好参数，例如数据库选择和期望得分阈值等。

提交查询后，BLAST会开始运行分析，并显示一个结果页面。你可以在结果页面上找到各种信息。

首先，你会看到一个总览，其中包含查询序列的信息，匹配到的序列数量以及最佳匹配的序列。这可以让你了解到BLAST的总体情况。

下一部分是比对结果表格，其中列出了匹配到的序列及其相关信息。这些信息通常包括序列的名称、匹配到的区域长度、匹配的分数以及比对的相似性等。你可以通过点击每个序列的链接来查看详细的比对结果。

在比对结果中，你还可以查看图形化的比对图。这些图可以帮助你更直观地了解查询序列和目标序列的比对情况。

此外，还可以在结果页面上使用筛选和排序功能来定制显示的结果。例如，你可以按照分数降序排列结果，或根据特定的匹配特征进行筛选。

最后，你可以下载或保存结果以便后续分析。BLAST结果通常以文本文件或HTML格式提供，你可以将其保存到本地计算机。

总的来说，在BLAST结果页面上你可以找到关于查询序列匹配的详细信息，包括匹配的序列和其相关特征。你可以进一步分析这些信息，以了解与查询序列相似或相关的其他序列。

ncbi在线blast结果

NCBI（美国国家生物技术信息中心）的在线BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一种用于比对和比较核酸和蛋白质序列的工具。它被广泛应用于寻找序列相似性和功能注释。

在线BLAST的使用非常简便。首先，将待比对的序列复制到输入框中，并选择比对类型（核酸-核酸、蛋白-蛋白）和数据库。然后，点击运行BLAST按钮，系统会自动将输入序列与所选择的数据库中的序列进行比对。

比对结果以表格形式展示，其中包含多个重要信息。首先，每个比对结果都有一个E值，用于描述比对的期望统计值，E值越小表示比对结果越可靠。比对结果还显示了比对的得分和匹配长度，可以帮助用户评估比对的质量。

比对结果还提供了比对序列的相似性：BLAST将输入序列与数据库中的序列逐个比对，并根据序列相似性分数进行排序。用户可以根据比对结果中的相似性和得分选择相应的比对序列。

此外，结果还提供了对比对序列的注释信息。通过比对结果，用户可以了解比对序列在数据库中可能的功能和相关信息，帮助进一步理解序列的生物学意义。

总之，NCBI的在线BLAST提供了一种简单而强大的工具，用于比较和注释生物序列。通过比对结果，用户可以评估序列相似性和功能，并深入研究序列的生物学意义。